RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF141Q15928 474 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 RIT1Q92963 219 aa24.78■■□□□ 1.56
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SH3BP2-221ENST00000511747 SLC25A38Q96DW6 304 aa24.78■■□□□ 1.56
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SH3BP2-221ENST00000511747 VSTM2LQ96N03 204 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
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SH3BP2-221ENST00000511747 RABL2BQ9UNT1 228 aa24.78■■□□□ 1.56
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SH3BP2-221ENST00000511747 RPS4Y2Q8TD47 263 aa24.75■■□□□ 1.55
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SH3BP2-221ENST00000511747 SLC35F3Q8IY50 421 aa24.75■■□□□ 1.55
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SH3BP2-221ENST00000511747 LINC01590Q5TEZ4 76 aa24.74■■□□□ 1.55
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SH3BP2-221ENST00000511747 GPR174Q9BXC1 333 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-221ENST00000511747 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-221ENST00000511747 CDCP1Q9H5V8 836 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-221ENST00000511747 TGFBR3LH3BV60 316 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-221ENST00000511747 ITGA10O75578 1167 aa24.74■■□□□ 1.55
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