RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa21.58■■□□□ 1.05
ALYREF-203ENST00000511412 MAL2Q969L2 176 aa21.58■■□□□ 1.05
ALYREF-203ENST00000511412 SLC35B4Q969S0 331 aa21.58■■□□□ 1.05
ALYREF-203ENST00000511412 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
ALYREF-203ENST00000511412 OBP2BQ9NPH6 170 aa21.58■■□□□ 1.05
ALYREF-203ENST00000511412 RASD1Q9Y272 281 aa21.58■■□□□ 1.05
ALYREF-203ENST00000511412 C5orf58C9J3I9 102 aa21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF587BE7ETH6 402 aa21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 BMP2P12643 396 aa21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 SELENOPP49908 381 aa21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 DSCR9P59020 149 aa21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 NIPAL3Q6P499 406 aa21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 CREB3L2Q70SY1 520 aa21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 BOD1Q96IK1 185 aa21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 C7orf26Q96N11 449 aa21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 TCF7L2Q9NQB0 619 aa21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM45AQ9NWC5 275 aa21.57■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 OR6C65A6NJZ3 312 aa21.56■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 BMP4P12644 408 aa21.56■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 HOXC5Q00444 222 aa21.56■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 OR10H5Q8NGA6 315 aa21.56■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 OR1K1Q8NGR3 316 aa21.56■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 MFSD8Q8NHS3 518 aa21.56■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 HTRA1Q92743 480 aa21.56■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa21.56■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 LGI1O95970 557 aa21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 PNMTP11086 282 aa21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 RPS5P46782 204 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 CHRNB3Q05901 458 aa21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 ELOA3BQ3SY89 546 aa21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 TBRG1Q3YBR2 411 aa21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 EPHX4Q8IUS5 362 aa21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 ELOA3Q8NG57 546 aa21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 SLC25A36Q96CQ1 311 aa21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 MDFIQ99750 246 aa21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 PTDSS2Q9BVG9 487 aa21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 YAE1D1Q9NRH1 226 aa21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 MOKQ9UQ07 419 aa21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 FTCDNL1E5RQL4 147 aa21.54■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 TGDSO95455 350 aa21.54■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 ETS2P15036 469 aa21.54■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 PRKAR1BP31321 381 aa21.54■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 LGALS3BPQ08380 585 aa21.54■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 LRIF1Q5T3J3 769 aa21.54■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 GCNT6Q5T4J0 391 aa21.54■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 C6orf89Q6UWU4 347 aa21.54■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF525Q8N782 197 aa21.54■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa21.54■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 ABCA1O95477 2261 aa21.54■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 SONP18583 2426 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 A0A096LNT2 108 aa21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 NR5A2O00482 541 aa21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 ARAFP10398 606 aa21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 PAX7P23759 505 aa21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 EGR4Q05215 589 aa21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 AGBL2Q5U5Z8 902 aa21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 NFKBIDQ8NI38 313 aa21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC8CQ8TDW0 803 aa21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 SPDL1Q96EA4 605 aa21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 SLC38A2Q96QD8 506 aa21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 KCNS3Q9BQ31 491 aa21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 LINC00470Q9BZP3 86 aa21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 C12orf10Q9HB07 376 aa21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC167Q9P0B6 97 aa21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 UPK3AO75631 287 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 SLC25A16P16260 332 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF43P17038 809 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 PPIBP23284 216 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 IDH3AP50213 366 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 HMBOX1Q6NT76 420 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 C5orf46Q6UWT4 87 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 LINGO2Q7L985 606 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 FUNDC1Q8IVP5 155 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 MSRB3Q8IXL7 192 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 KDM8Q8N371 416 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 FAM168AQ92567 244 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 EBF4Q9BQW3 602 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 RCE1Q9Y256 329 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-203ENST00000511412 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa21.51■■□□□ 1.03
ALYREF-203ENST00000511412 GPRIN2O60269 458 aa21.51■■□□□ 1.03
ALYREF-203ENST00000511412 CSF3P09919 207 aa21.51■■□□□ 1.03
ALYREF-203ENST00000511412 EFNA4P52798 201 aa21.51■■□□□ 1.03
ALYREF-203ENST00000511412 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms