RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF583Q96ND8 569 aa16.48■□□□□ 0.23
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SH3BP2-218ENST00000511185 OR2T12Q8NG77 320 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 CCL19Q99731 98 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 SH3GL1Q99961 368 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 GID8Q9NWU2 228 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC7A7Q9UM01 511 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 RASD1Q9Y272 281 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 CIB4A0PJX0 185 aa16.43■□□□□ 0.22
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