RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 CREB3L2Q70SY1 520 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 RIMKLAQ8IXN7 391 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 CMIPQ8IY22 773 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 CDK20Q8IZL9 346 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 OR51F2Q8NH61 342 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 CLDND2Q8NHS1 167 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 MIPOL1Q8TD10 442 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 MS4A5Q9H3V2 200 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 CRLF2Q9HC73 371 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 TREM2Q9NZC2 230 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 CFAP73A6NFT4 308 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 UPK3AO75631 287 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 TFP02787 698 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 CELA3BP08861 270 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 SAGP10523 405 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 G6PDP11413 515 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 ANPEPP15144 967 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 EPHA1P21709 976 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 GNA13Q14344 377 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 GSTA3Q16772 222 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 OR4F3Q6IEY1 312 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 FRRS1Q6ZNA5 592 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 MNS1Q8NEH6 495 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 VPS37AQ8NEZ2 397 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 TUBGCP3Q96CW5 907 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 C3orf30Q96M34 536 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 SYNGR3O43761 229 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 IL7RP16871 459 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 KRT4P19013 534 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 UQCRC2P22695 453 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 COL8A2P25067 703 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 CAPZA2P47755 286 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 CLDN8P56748 225 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM33P57088 247 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 ARF1P84077 181 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 PCLAFQ15004 111 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 AWAT1Q58HT5 328 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 XKR7Q5GH72 579 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF311Q5JNZ3 666 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 PRR31Q5SQ13 230 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 KRT80Q6KB66 452 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 RDH5Q92781 318 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 SUCNR1Q9BXA5 334 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 LINC00470Q9BZP3 86 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 DPY30Q9C005 99 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 NOX1Q9Y5S8 564 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 TRAV20A0A0B4J274 112 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 M0R233 179 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 FAAHO00519 579 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 PPIHO43447 177 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 NPHS1O60500 1241 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 BCL10O95999 233 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 PNPP00491 289 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 GAAP10253 952 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 ACHEP22303 614 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 EVX1P49640 407 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 COPZ1P61923 177 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 MYBPC1Q00872 1141 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 REP15Q6BDI9 236 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 LINGO2Q7L985 606 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 ANKRD46Q86W74 232 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 CARM1Q86X55 608 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 EPHX4Q8IUS5 362 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 IFT20Q8IY31 132 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 NOX3Q9HBY0 568 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 RASD1Q9Y272 281 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 LOC105371242A0A075B767 164 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 AGAP5A6NIR3 686 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 SMIM23A6NLE4 172 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 A8MVM7 634 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM229AB2RXF0 380 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 CHRM4P08173 479 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 NR4A1P22736 598 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 ARFIP2P53365 341 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 DEFA6Q01524 100 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 FUT5Q11128 374 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 BNIP2Q12982 314 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 ELFN2Q5R3F8 820 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 ANXA8L1Q5VT79 327 aa13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms