RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC35D3Q5M8T2 416 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 PHF19Q5T6S3 580 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 C22orf42Q6IC83 251 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM91Q6ZNR0 172 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 ADGRG3Q86Y34 549 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 MISPQ8IVT2 679 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFP41Q8N8Y5 198 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 GALNT6Q8NCL4 622 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 SDR9C7Q8NEX9 313 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF563Q8TA94 476 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 METTL21AQ8WXB1 218 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM203Q969S6 136 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A46Q96AG3 418 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 COX4I2Q96KJ9 171 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 KCTD7Q96MP8 289 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 LPAR4Q99677 370 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 TM9SF2Q99805 663 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 KATNB1Q9BVA0 655 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 PTDSS2Q9BVG9 487 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR54Q9H977 334 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 FKRPQ9H9S5 495 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 SMURF1Q9HCE7 757 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 TBCCD1Q9NVR7 557 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF229Q9UJW7 825 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 WASF3Q9UPY6 502 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 NOX1Q9Y5S8 564 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM72A0PK05 275 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM8BA6NDV4 472 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 E9PI62 339 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 AGRPO00253 132 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGEB3O15480 346 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF13O43567 381 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFAND5O76080 213 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 SNX4O95219 450 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 MT-ND5P03915 603 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 HLA-DPB1P04440 258 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 GYPBP06028 91 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2T7P0C7T2 308 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF28P17035 718 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 CELP19835 753 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 TNFSF8P32971 234 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL4P36578 427 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 NRG3P56975 720 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS7P62081 194 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 ACTC1P68032 377 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 ACTA1P68133 377 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 LGALS3BPQ08380 585 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 CBFBQ13951 182 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 QPRTQ15274 297 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 RGS21Q2M5E4 152 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 EMC4Q5J8M3 183 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC01590Q5TEZ4 76 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 PARP16Q8N5Y8 322 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 POMGNT2Q8NAT1 580 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 OR10H4Q8NGA5 316 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5L2Q8NGL0 311 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2T27Q8NH04 317 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 OR6S1Q8NH40 331 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 ZPLD1Q8TCW7 415 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 DUSP19Q8WTR2 217 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 TTC9Q92623 222 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 Q96M85 177 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 WDFY2Q96P53 400 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 DEPDC7Q96QD5 511 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 NMNAT3Q96T66 252 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 CTRCQ99895 268 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNS3Q9BQ31 491 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 NANSQ9NR45 359 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 SNTG1Q9NSN8 517 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 TOR4AQ9NXH8 423 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 LHX6Q9UPM6 363 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 CHD8Q9HCK8 2581 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP2-209ENST00000504450 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms