RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493976.1

AKAP9-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 3

Gene AKAP9, Length 724 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-215	ENST00000493976	EGR4	Q05215	589 aa		13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	COMTD1	Q86VU5	262 aa		13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	KDM8	Q8N371	416 aa		13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	MAL2	Q969L2	176 aa		13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	FBXO17	Q96EF6	278 aa		13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	BOD1	Q96IK1	185 aa		13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	FKRP	Q9H9S5	495 aa		13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
AKAP9-215	ENST00000493976	RNF212B	A8MTL3	300 aa		13.83	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		13.83	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	SLC25A16	P16260	332 aa		13.83	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	EFNA4	P52798	201 aa		13.83	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	DSCR9	P59020	149 aa		13.83	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		13.83	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		13.83	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	NIPAL3	Q6P499	406 aa		13.83	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	C10orf111	Q8N326	155 aa		13.83	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		13.83	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976		A0A096LPE4	126 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976		A0A1W2PPZ6	126 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	VWC2L	B2RUY7	222 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	ANP32D	O95626	131 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	WNT11	O96014	354 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	PNMT	P11086	282 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	CALCR	P30988	508 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	COPZ1	P61923	177 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	ATG16L1	Q676U5	607 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	TMEM225	Q6GV28	225 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	GTF2H4	Q92759	462 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	CALML5	Q9NZT1	146 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	13.82	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976		A0A0G2JPF8	293 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	CELA3B	P08861	270 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	CECR9	P0C854	216 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	HTR2A	P28223	471 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	CHRNB3	Q05901	458 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	ITCH	Q96J02	903 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	PIF1	Q9H611	641 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	CA10	Q9NS85	328 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	FZD7	O75084	574 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	KRT33A	O76009	404 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF432	O94892	652 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	AHSA1	O95433	338 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	FAM157C	P0CG43	387 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	NAAA	Q02083	359 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	RGN	Q15493	299 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	STK35	Q8TDR2	534 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	PROX1	Q92786	737 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	KCNK17	Q96T54	332 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	PRR14	Q9BWN1	585 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	RMND5A	Q9H871	391 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-215	ENST00000493976	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2

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