RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	BIVM	Q86UB2	503 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF217	Q8TC41	542 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM162A	Q96A26	154 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	S100PBP	Q96BU1	408 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	RADIL	Q96JH8	1075 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL5B	Q96KC2	179 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CDRT15	Q96T59	188 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	HS3ST1	O14792	307 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	FMO6P	O60774	539 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	VAMP5	O95183	116 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PNMT	P11086	282 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CCNA2	P20248	432 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PAX7	P23759	505 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A3	Q00325	362 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TAB1	Q15750	504 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP7	Q16829	419 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ULK3	Q6PHR2	472 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	P3H2	Q8IVL5	708 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ELOA3	Q8NG57	546 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TAMM41	Q96BW9	452 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	MUCL1	Q96DR8	90 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	BOD1	Q96IK1	185 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TPD52L3	Q96J77	140 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	C18orf12	Q96KH6	178 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL19	Q99731	98 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf10	Q9HB07	376 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	MALT1	Q9UDY8	824 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		15.28	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	NF1	P21359	2839 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424		A8MVM7	634 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	FRS3	O43559	492 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	GPI	P06744	558 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PRG2	P13727	222 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CD247	P20963	164 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SELENOW	P63302	87 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	NRF1	Q16656	503 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	APH1A	Q96BI3	265 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	MCHR1	Q99705	422 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGDIG	Q99819	225 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		15.27	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	FZD7	O75084	574 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	STAMBP	O95630	424 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF682	O95780	498 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	GGT1	P19440	569 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXC5	Q00444	222 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	GLYAT	Q6IB77	296 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	STK35	Q8TDR2	534 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM45B	Q96B21	275 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	BDH2	Q9BUT1	245 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf21	Q9H246	121 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	USP22	Q9UPT9	525 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	DSCAM	O60469	2012 aa		15.26	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM72	A0PK05	275 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5H1	A6NKK0	313 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424		M0R3H8	397 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CD3E	P07766	207 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	HSD17B1	P14061	328 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RASSF2	P50749	326 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2B6	P58173	313 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC17A1	Q14916	467 aa		15.25	■□□□□ 0.03

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