RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 NIT2Q9NQR4 276 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 DYRK4Q9NR20 520 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ABCC13Q9NSE7 274 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 EXD2Q9NVH0 621 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 DMAC2Q9NW81 257 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 IMPAD1Q9NX62 359 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CMTM6Q9NX76 183 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SCN3BQ9NY72 215 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SPHK1Q9NYA1 384 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 B3GAT1Q9P2W7 334 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 IL19Q9UHD0 177 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 KIF25Q9UIL4 384 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MGAT4AQ9UM21 535 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF6Q9Y252 685 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ABCA3Q99758 1704 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RGPD5Q99666 1765 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A075B6Q4 140 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PP18 115 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM74A7A6NL05 159 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 H0YIV9 168 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 LGALS8O00214 317 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 NDUFS8O00217 210 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 NME4O00746 187 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 BCKDKO14874 412 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 OGTO15294 1046 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC31A2O15432 143 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HCN1O60741 890 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HPGDSO60760 199 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GJB3O75712 270 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.832e-7■□□□□ 8
RABGGTB-210ENST00000485459 RBBP9O75884 186 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SUPT7LO94864 414 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ANGPTL1O95841 491 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CALCAP01258 141 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MT-ND1P03886 318 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CSF2P04141 144 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 S100A8P05109 93 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CHRNGP07510 517 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 IGHV4-31P0DP07 118 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HLA-EP13747 358 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CTNNB1P35222 781 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MMP12P39900 470 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CDKN2BP42772 138 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 NOVP48745 357 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 LIG4P49917 911 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CDH13P55290 713 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PRMT2P55345 433 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PAX9P55771 341 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ERVK-25P63136 954 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 DYNLT1P63172 113 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GTF2BQ00403 316 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 IL5RAQ01344 420 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 FGL1Q08830 312 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 COTL1Q14019 142 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 EMC2Q15006 297 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TRAM2Q15035 370 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SNAI3Q3KNW1 292 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM74A3Q4VXF1 159 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TFDP3Q5H9I0 405 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 OR2B11Q5JQS5 317 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 LRRC38Q5VT99 294 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF691Q5VV52 312 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF470Q6ECI4 717 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ELP2Q6IA86 826 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 C3orf33Q6P1S2 294 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ERICH5Q6P6B1 374 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ATRAIDQ6UW56 229 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RTN4RL2Q86UN3 420 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PAQR7Q86WK9 346 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC22A9Q8IVM8 553 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RIMKLAQ8IXN7 391 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 Q8NFD4 153 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 OR1M1Q8NGA1 313 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 OR56B2PQ8NGI1 322 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 OR8D4Q8NGM9 314 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 OR13C3Q8NGS6 347 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 AKR7LQ8NHP1 331 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CNIH3Q8TBE1 160 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RDH11Q8TC12 318 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SDR42E1Q8WUS8 393 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms