RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479541.1

RNF216-208, Transcript of ring finger protein 216, human

TSL 4

Gene RNF216, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF216-208	ENST00000479541	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	OR2T33	Q8NG76	320 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	CITED1	Q99966	193 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	TCHP	Q9BT92	498 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	TM2D1	Q9BX74	207 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	NUDT15	Q9NV35	164 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	CDH9	Q9ULB4	789 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	USP16	Q9Y5T5	823 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541		H0Y8G0	127 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541		H3BMQ9	156 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	PRRG1	O14668	218 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	VENTX	O95231	258 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	IL1B	P01584	269 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	IGHG3	P01860	377 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	FOLR2	P14207	255 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	IGHV1-2	P23083	117 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	LAP3	P28838	519 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	SULT1E1	P49888	294 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	SLC25A1	P53007	311 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	TRDN	Q13061	729 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	BOLA3	Q53S33	107 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	UTS2B	Q765I0	119 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	FAM222B	Q8WU58	562 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	PIGC	Q92535	297 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	COQ2	Q96H96	371 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	CNDP1	Q96KN2	507 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	ASB3	Q9Y575	518 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	IGF2R	P11717	2491 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541		A0A1B0GUL6	1792 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541		A0A087WWV3	80 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC169	A6NNP5	214 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541		G3V4G9	280 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	FCN1	O00602	326 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	RS1	O15537	224 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	EFNA2	O43921	213 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	B4GALT2	O60909	372 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	ANXA13	P27216	316 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	P2RY1	P47900	373 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	TAF6	P49848	677 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	ST3GAL3	Q11203	375 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	ASAH1	Q13510	395 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	DPYSL3	Q14195	570 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	C15orf32	Q32M92	178 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	EIPR1	Q53HC9	387 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF216-208	ENST00000479541	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		3.56	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms