RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 LY6G6DO95868 133 aa11.46□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 CD3EP07766 207 aa11.46□□□□□ -0.57
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HPS1-211ENST00000478087 CXCR1P25024 350 aa11.46□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SLC16A1P53985 500 aa11.46□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SLC35A1P78382 337 aa11.46□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 LGALS3BPQ08380 585 aa11.46□□□□□ -0.57
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HPS1-211ENST00000478087 SLC13A4Q9UKG4 626 aa11.44□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 SLC25A15Q9Y619 301 aa11.44□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 JMJD1CQ15652 2540 aa11.43□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 A8MVM7 634 aa11.43□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 TMEM229AB2RXF0 380 aa11.43□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 OVOL3O00110 214 aa11.43□□□□□ -0.58
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