RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	CXCR2	P25025	360 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	GCA	P28676	217 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	LAP3	P28838	519 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SHMT2	P34897	504 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PRRX1	P54821	245 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	UCN	P55089	124 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	GBE1	Q04446	702 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PLD1	Q13393	1074 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	UNC119	Q13432	240 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	MPPED2	Q15777	294 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC80	Q76M96	950 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	VSTM4	Q8IW00	320 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	C6orf223	Q8N319	242 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PNKD	Q8N490	385 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RASD2	Q96D21	266 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TGM7	Q96PF1	710 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	NPAS2	Q99743	824 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	NAT9	Q9BTE0	207 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	YY1AP1	Q9H869	796 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SGK2	Q9HBY8	427 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CDH9	Q9ULB4	789 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	GJE1	A6NN92	205 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF716	A6NP11	495 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	IDS	B3KWA1	339 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	MBTPS2	O43462	519 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CA11	O75493	328 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	IGHV4-34	P06331	123 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF735	P0CB33	412 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SLC2A3	P11169	496 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PSG2	P11465	335 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	GAL	P22466	123 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CALCR	P30988	508 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	GRIA1	P42261	906 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PKNOX1	P55347	436 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	C1orf61	Q13536	156 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	IDI1	Q13907	227 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	GRB7	Q14451	532 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	BCL7A	Q4VC05	210 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	BEND3	Q5T5X7	828 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	UTS2B	Q765I0	119 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RDH10	Q8IZV5	341 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	FANK1	Q8TC84	345 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	AGR3	Q8TD06	166 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	IL22RA2	Q969J5	263 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	KCNA7	Q96RP8	456 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	HIST1H4G	Q99525	98 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF225	Q9UK10	706 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	COPS3	Q9UNS2	423 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	NACA	E9PAV3	2078 aa		2.74	□□□□□ -1.97

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