RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 COMTD1Q86VU5 262 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 BEST3Q8N1M1 668 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 OR2M3Q8NG83 312 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 MYDGFQ969H8 173 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CNBD2Q96M20 576 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 MUS81Q96NY9 551 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ASPNQ9BXN1 380 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 DSN1Q9H410 356 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 FN3KQ9H479 309 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 VNN3Q9NY84 501 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 MED11Q9P086 117 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SVILO95425 2214 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CROCCQ5TZA2 2017 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 A0A087WXM4 84 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ACOT7O00154 380 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ARPC3O15145 178 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SUSD5O60279 629 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 NPIPB7O75200 414 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 OR7A10O76100 309 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 NTN1O95631 604 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 THY1P04216 161 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SP1P08047 785 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 NR2C1P13056 603 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 POU2F1P14859 743 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 HK1P19367 917 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 POU1F1P28069 291 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 TTKP33981 857 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 GRK5P34947 590 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 PTGDSP41222 190 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CAPZA2P47755 286 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 BLVRAP53004 296 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 FOXL2P58012 376 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 RAC1P63000 192 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 MYBPC1Q00872 1141 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 IL5RAQ01344 420 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 LGALS3BPQ08380 585 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZP4Q12836 540 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SELENBP1Q13228 472 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CDK5R2Q13319 367 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SLC10A1Q14973 349 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 OR1C1Q15619 314 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SNAPC1Q16533 368 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 BCL2A1Q16548 175 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 LNX2Q8N448 690 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 GATSQ8NAP1 163 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 FNDC8Q8TC99 324 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms