RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	PRB1	P04280	392 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CD14	P08571	375 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC159	P0C7I6	412 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	IMPDH2	P12268	514 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CCNA2	P20248	432 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	IL11	P20809	199 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	IDUA	P35475	653 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CHN2	P52757	468 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	FOXK1	P85037	733 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	MYBPH	Q13203	477 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	EMC4	Q5J8M3	183 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CASP12	Q6UXS9	341 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	OR51A7	Q8NH64	312 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	FANK1	Q8TC84	345 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SAMD8	Q96LT4	415 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529		Q96MT0	163 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	FN3K	Q9H479	309 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	KLHL1	Q9NR64	748 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF6	Q9Y252	685 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1B0GVC2	190 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRN3	E7EW58	273 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	MS4A18	H0YCH9	400 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SOX14	O95416	240 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ACTL6A	O96019	429 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	IGHG3	P01860	377 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	GDF1	P27539	372 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	GRPR	P30550	384 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PCYT1A	P49585	367 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	RAC3	P60763	192 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC35A1	P78382	337 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	MYBPC1	Q00872	1141 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	INA	Q16352	499 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PGGHG	Q32M88	737 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	RAET1L	Q5VY80	246 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PCSK4	Q6UW60	755 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	WBP1	Q96G27	269 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ADGRG7	Q96K78	797 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ASPN	Q9BXN1	380 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CMC2	Q9NRP2	79 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529		M0R3G1	203 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	ACOT7	O00154	380 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	SURF4	O15260	269 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAPPC6A	O75865	159 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	VAMP5	O95183	116 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	TNFAIP8	O95379	198 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	IGHM	P01871	453 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	AQP2	P41181	271 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	P2RY4	P51582	365 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	IL5RA	Q01344	420 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	PMS2P3	Q13401	168 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	TMED1	Q13445	227 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	SNAPC1	Q16533	368 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	ALG10	Q5BKT4	473 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC6A19	Q695T7	634 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	VASN	Q6EMK4	673 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		11.45	□□□□□ -0.58

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