RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 VAPAQ9P0L0 249 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 TRIM64BA6NI03 449 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 E7EQL1 145 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 NR5A2O00482 541 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 KRT33AO76009 404 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 AHSA1O95433 338 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 WNT11O96014 354 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 TTKP33981 857 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF83P51522 516 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 P2RY4P51582 365 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 RBBP4Q09028 425 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 TNK1Q13470 666 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ULK3Q6PHR2 472 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SLC22A25Q6T423 547 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 GPAT4Q86UL3 456 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ELOA3Q8NG57 546 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 OR6S1Q8NH40 331 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SLC38A4Q969I6 547 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 OXGR1Q96P68 337 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 FKRPQ9H9S5 495 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SELENONQ9NZV5 590 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 CR1P17927 2039 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1B0GWA3 101 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PR80 420 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 M0R1B8 84 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 AIM2O14862 343 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 FRS3O43559 492 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 TPST1O60507 370 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 FZD7O75084 574 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 C8BP07358 591 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 BMP4P12644 408 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF43P17038 809 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 CDKN1AP38936 164 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 FABP6P51161 128 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 CDH11P55287 796 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 DSCR9P59020 149 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 HOXC5Q00444 222 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 EGR4Q05215 589 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 CHRNB3Q05901 458 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SCARB2Q14108 478 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 RAB35Q15286 201 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ADRM1Q16186 407 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 NRF1Q16656 503 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF544Q6NX49 715 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
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