RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 OR14I1A6ND48 311 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SOCS2O14508 198 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TIPRLO75663 272 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 FMO3P31513 532 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 APOFQ13790 326 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 PDE7AQ13946 482 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 LACC1Q8IV20 430 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CADM3Q8N126 398 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 STEAP2Q8NFT2 490 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 FANK1Q8TC84 345 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 NUDT8Q8WV74 236 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 PIP5K1AQ99755 562 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 RAB19A4D1S5 217 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 AQP12BA6NM10 295 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SYT5O00445 386 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 NDUFB2O95178 105 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 OR5F1O95221 314 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 LCKP06239 509 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 HTR1EP28566 365 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 GRPRP30550 384 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CSRP3P50461 194 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 RIN1Q13671 783 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 POU4F3Q15319 338 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.065e-10■■■■■ 34.6
DDX39B-215ENST00000462256 RGS21Q2M5E4 152 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 Q6ZS92 163 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 BEND4Q6ZU67 534 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 AQP12AQ8IXF9 295 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 APCDD1LQ8NCL9 501 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 GLRX2Q9NS18 164 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TINAGQ9UJW2 476 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.41□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 PCM1Q15154 2024 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 UNC119BA6NIH7 251 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 HMGN4O00479 90 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TNFRSF1BP20333 461 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 GGT2P36268 569 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 GPR4P46093 362 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 HAAOP46952 286 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SELENOWP63302 87 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 PSG6Q00889 435 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CDONQ4KMG0 1287 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 XKRXQ6PP77 449 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SLC16A14Q7RTX9 510 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 OR4K5Q8NGD3 323 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF566Q969W8 418 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TVP23BQ9NYZ1 205 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CYB5AP00167 134 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CHRNB4P30926 498 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 S100A5P33763 92 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ACVR1BP36896 505 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 MALLQ13021 153 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 KEAP1Q14145 624 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 AQP11Q8NBQ7 271 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 VOPP1Q96AW1 172 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TEX37Q96LM6 180 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF681Q96N22 645 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 PITX2Q99697 317 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ANGPTL4Q9BY76 406 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SP140LQ9H930 580 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 DNAJB9Q9UBS3 223 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 DENND4CQ5VZ89 1909 aa8.4□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 MFN2O95140 757 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TNFSF4P23510 183 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 IL12AP29459 219 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PCBD1P61457 104 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CAMK2DQ13557 499 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TRIM16LQ309B1 348 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.4□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms