RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 NEUROG1Q92886 237 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35B4Q969S0 331 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 S100PBPQ96BU1 408 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC46Q96FV0 321 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF607Q96SK3 696 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 MED18Q9BUE0 208 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 GP6Q9HCN6 339 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 NDRG3Q9UGV2 375 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 DPRXA6NFQ7 191 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 M0R082 166 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 DNPH1O43598 174 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 UPK3AO75631 287 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINB7O75635 380 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 NPPAP01160 153 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 GPIP06744 558 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 C8BP07358 591 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 PNMTP11086 282 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 CD53P19397 219 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 COX5AP20674 150 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 GRPRP30550 384 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 KDELR2P33947 212 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 PEX19P40855 299 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 SELENOPP49908 381 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 COPZ1P61923 177 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A3Q00325 362 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 FAPQ12884 760 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ITGADQ13349 1161 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZT83 130 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 CARM1Q86X55 608 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT73Q86Y46 540 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 MICU2Q8IYU8 434 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR31Q8NA23 367 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 PIGXQ8TBF5 258 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ECSITQ9BQ95 431 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 C12orf10Q9HB07 376 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 GID8Q9NWU2 228 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 F8P00451 2351 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ITPR3Q14573 2671 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 J3KTA2 159 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 DYNC1I1O14576 645 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 CASKO14936 926 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC22A2O15244 555 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC22O60826 627 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF432O94892 652 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ATE1O95260 518 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 UQCRBP14927 111 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 NCK1P16333 377 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 FUT1P19526 365 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 GSK3BP49841 420 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP2K6P52564 334 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC7A2P52569 658 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT2B15P54855 530 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 PSME3P61289 254 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 LIPEQ05469 1076 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
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