RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 PEX5LQ8IYB4 626 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 KDM8Q8N371 416 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CADM2Q8N3J6 435 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 GTF2H4Q92759 462 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TLCD1Q96CP7 247 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 WFDC6Q9BQY6 131 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CENPHQ9H3R5 247 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIF1Q9H611 641 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADPRHL2Q9NX46 363 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 P2RX2Q9UBL9 471 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 UPB1Q9UBR1 384 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC35F4A4IF30 521 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 A8MVM7 634 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC22A3O75751 556 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV3-15P01624 115 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV1-44P01699 117 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL6P05231 212 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CELA3BP08861 270 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 IDO1P14902 403 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A16P16260 332 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CXCR1P25024 350 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 HTR2AP28223 471 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CALCRP30988 508 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRATP43155 626 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 EFNA4P52798 201 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRISP3P54108 245 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC18A1P54219 525 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRPS1P60891 318 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOXC5Q00444 222 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 RGNQ15493 299 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa7.35□□□□□ -1.23
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GAPDHP28-201ENST00000455134 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.35□□□□□ -1.23
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GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC2A7Q6PXP3 512 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 C6orf89Q6UWU4 347 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPAT4Q86UL3 456 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 POMGNT2Q8NAT1 580 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 MFSD8Q8NHS3 518 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 MGARPQ8TDB4 240 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 STK35Q8TDR2 534 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM168AQ92567 244 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAL2Q969L2 176 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXO17Q96EF6 278 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOX7Q9BT81 388 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR14Q9BWN1 585 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 BCL2L10Q9HD36 194 aa7.35□□□□□ -1.23
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GAPDHP28-201ENST00000455134 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A0G2JPF8 293 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM129A0AVI4 362 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TPST1O60507 370 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TPST2O60704 377 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 VAMP5O95183 116 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 HPRP00739 348 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CECR9P0C854 216 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM157CP0CG43 387 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGFBP5P24593 272 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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