RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC103	Q8IW40	242 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM99	Q8N816	258 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	RNF217	Q8TC41	542 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	TAAR8	Q969N4	342 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	DACH2	Q96NX9	599 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	BGLAP	P02818	100 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	THY1	P04216	161 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	EPX	P11678	715 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	NCK1	P16333	377 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	KLK2	P20151	261 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	OR1E2	P47887	323 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	RNF148	Q8N7C7	305 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	APH1A	Q96BI3	265 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	OXGR1	Q96P68	337 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ASPN	Q9BXN1	380 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	FKRP	Q9H9S5	495 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ARPC2	O15144	300 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	RAMP1	O60894	148 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ITGA2	P17301	1181 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	TNFRSF1B	P20333	461 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	C12orf49	Q9H741	205 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	MALT1	Q9UDY8	824 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	RCE1	Q9Y256	329 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ABCA4	P78363	2273 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ITPR2	Q14571	2701 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	SH3D21	A4FU49	640 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241		M0R082	166 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ATP5H	O75947	161 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	UBOX5	O94941	541 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	MT-ND1	P03886	318 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF43	P17038	809 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	RHCE	P18577	417 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	GRPR	P30550	384 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	FAM27E3	Q08E93	113 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF74	Q16587	644 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	RINL	Q6ZS11	566 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	OR5J2	Q8NH18	312 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM239	Q8WW34	195 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	LIPH	Q8WWY8	451 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	NANS	Q9NR45	359 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PTPA-222	ENST00000445241	NOTCH2	Q04721	2471 aa		12.96	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	FAM221A	A4D161	298 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS23	O95084	383 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	COX5A	P20674	150 aa		12.95	□□□□□ -0.34

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