RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 HSBP1O75506 76 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 GJB5O95377 273 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 EOMESO95936 686 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 FDXRP22570 491 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A2P23975 617 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 HRH2P25021 359 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ITPKBP27987 946 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 CAPZBP47756 277 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 BLKP51451 505 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF528Q3MIS6 628 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 PIGZQ86VD9 579 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 BATF2Q8N1L9 274 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 OR4K17Q8NGC6 315 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ARRDC2Q8TBH0 407 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 DUSP19Q8WTR2 217 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ASB13Q8WXK3 278 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM37Q8WXS4 190 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 APIPQ96GX9 242 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 DGAT2Q96PD7 388 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 KCNK12Q9HB15 430 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 LAMP3Q9UQV4 416 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 USP3Q9Y6I4 520 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 PTPRKQ15262 1439 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 OR2AG2A6NM03 316 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 FZD9O00144 591 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 CST4P01036 141 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 TGFAP01135 160 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 TK1P04183 234 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 IFNW1P05000 195 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 PMCHP20382 165 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 GYG1P46976 350 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 TDGF1P3P51864 188 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 BACE1P56817 501 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 TEX44Q53QW1 395 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 AGBL4Q5VU57 503 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 MFSD14CQ5VZR4 134 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF562Q6V9R5 426 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 NPSR1Q6W5P4 371 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZRG5 221 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 AMIGO3Q86WK7 504 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SLC7A13Q8TCU3 470 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 LMX1AQ8TE12 382 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 GPR78Q96P69 363 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF358Q9NW07 568 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ITSN2Q9NZM3 1697 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SULT2B1O00204 365 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 MOSPD3O75425 235 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 CXCL14O95715 111 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 HPP00738 406 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 F12P00748 615 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ADORA1P30542 326 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ARR3P36575 388 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 LIMS1P48059 325 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 TIFABQ6ZNK6 161 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 JOSD2Q8TAC2 188 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 HMGB4Q8WW32 186 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 UPRTQ96BW1 309 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 TVP23CQ96ET8 276 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ZBP1Q9H171 429 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 G6PC2Q9NQR9 355 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SYNJ1O43426 1573 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 A6NDN8 102 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 OR5H14A6NHG9 310 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 FAM183AA6NL82 134 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 CLDN34H7C241 214 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SGK494L7N484 410 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 FGF19O95750 216 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 HBE1P02100 147 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ILKQ13418 452 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ODF1Q14990 250 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
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