RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 ANXA2P2A6NMY6 339 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ZFPL1O95159 310 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 NUDT14O95848 222 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 HPGDP15428 266 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 AQP2P41181 271 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 PCGF3Q3KNV8 242 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 C4orf46Q504U0 113 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 OR6N2Q8NGY6 317 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ANGPTL6Q8NI99 470 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 MCCC2Q9HCC0 563 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 NCDNQ9UBB6 729 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 DTX4Q9Y2E6 619 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 SPACA6W5XKT8 324 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 OR6C68A6NDL8 312 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 PTH2RP49190 550 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 TAS2R43P59537 309 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 GAS6Q14393 721 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC35D2Q76EJ3 337 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 SMIM19Q96E16 107 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 TEX101Q9BY14 249 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 PRSS38A1L453 326 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 C17orf51A8MQB3 221 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 GOSR2O14653 212 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 PLATP00750 562 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP1B1P05026 303 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ITPKBP27987 946 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 RUNX3Q13761 415 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 COL28A1Q2UY09 1125 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 TPRA1Q86W33 373 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 LIX1LQ8IVB5 337 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 OR2M4Q96R27 311 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 HRASLS2Q9NWW9 162 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 LRIT1Q9P2V4 623 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 I3L1I5 382 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 APOC3P02656 99 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 C3P1Q6ZMU1 363 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 CFAP77Q6ZQR2 320 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 PRR22Q8IZ63 422 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 OR4D10Q8NGI6 311 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 OR51A4Q8NGJ6 313 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 BADQ92934 168 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 MNTQ99583 582 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 GSX2Q9BZM3 304 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 TRPV4Q9HBA0 871 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 NRIP3Q9NQ35 241 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 KLHL9Q9P2J3 617 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 FBXL2Q9UKC9 423 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC6A5Q9Y345 797 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 MEIKINA0A087WXM9 373 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM25EA8MYX2 175 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 J3QRE1 110 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 PIN1P1O15428 100 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 SERPINA3P01011 423 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 CSTAP01040 98 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 MMP15P51511 669 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 GPR18Q14330 331 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM74A1Q5RGS3 127 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC22A10Q63ZE4 541 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 OR2L13Q8N349 312 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ASB16Q96NS5 453 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 SORCS2Q96PQ0 1159 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF350Q9GZX5 532 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 CDC14CA4D256 554 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 FGF19O95750 216 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ACSM4P0C7M7 580 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 UGT2B7P16662 529 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 GAB4Q2WGN9 574 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 CDONQ4KMG0 1287 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 PPP1R14AQ96A00 147 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ANKRD19PQ9H560 264 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 FBXL3Q9UKT7 428 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 CAMK2AQ9UQM7 478 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF879B4DU55 563 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF35P13682 527 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 CXCL2P19875 107 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 MAOBP27338 520 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-202ENST00000440289 ACSM1Q08AH1 577 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms