RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF716	A6NP11	495 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	C5orf58	C9J3I9	102 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	GYG2	O15488	501 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ADAM11	O75078	769 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CD8A	P01732	235 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	NUDT7	P0C024	238 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	NR2F1	P10589	423 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	BMP4	P12644	408 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	UQCRB	P14927	111 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	GPX2	P18283	190 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	RYK	P34925	604 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	MAP2K6	P52564	334 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	NUDT6	P53370	316 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC16A1	P53985	500 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	KCNJ10	P78508	379 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	GNA13	Q14344	377 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CMIP	Q8IY22	773 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	PMM1	Q92871	262 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	DDIT4L	Q96D03	193 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ZG16B	Q96DA0	208 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CMTM6	Q9NX76	183 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	MALT1	Q9UDY8	824 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	SSX4	O60224	188 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	IGHV3-9	P01782	118 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	BCHE	P06276	602 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	EDNRA	P25101	427 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	TTK	P33981	857 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF83	P51522	516 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	OR2B6	P58173	313 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC35A1	P78382	337 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	TGFBR3	Q03167	851 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CHRNE	Q04844	493 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	LIPE	Q05469	1076 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	OR52N5	Q8NH56	324 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CDRT15	Q96T59	188 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	UPB1	Q9UBR1	384 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	GMEB1	Q9Y692	573 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	NME4	O00746	187 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF208	O43345	1280 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CD40	P25942	277 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	RAB35	Q15286	201 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF544	Q6NX49	715 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CASP12	Q6UXS9	341 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	SERPINA11	Q86U17	422 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	MUC15	Q8N387	334 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	MAL2	Q969L2	176 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM19	Q96HH6	336 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ARL5B	Q96KC2	179 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	MUS81	Q96NY9	551 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	C1orf21	Q9H246	121 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	FKRP	Q9H9S5	495 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CAD	P27708	2225 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CR1	P17927	2039 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028		M0R1B8	84 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	GSTA4	O15217	222 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	NDUFS7	O75251	213 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	BMP2	P12643	396 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	FABP6	P51161	128 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CDK6	Q00534	326 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CHRNB3	Q05901	458 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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