RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ACOX3O15254 700 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PIN1P1O15428 100 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 AKAP10O43572 662 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RDH16O75452 317 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 TUSC2O75896 110 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 MYO1DO94832 1006 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SCELO95171 688 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CCNDBP1O95273 360 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 IL6P05231 212 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 FHP07954 510 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 OR56A5P0C7T3 313 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CDH1P12830 882 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 GFAPP14136 432 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PCMT1P22061 227 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 LOXP28300 417 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PIGAP37287 484 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RGS4P49798 205 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SLC7A2P52569 658 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ESRRGP62508 458 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SKP1P63208 163 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 LGALS3BPQ08380 585 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 HSPA14Q0VDF9 509 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 MERTKQ12866 999 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 IL18R1Q13478 541 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R3AQ16821 1122 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 GGTA1PQ4G0N0 100 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 XKR6Q5GH73 641 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PLXDC2Q6UX71 529 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 DLEU7Q6UYE1 221 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZSR9 355 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SERPINA9Q86WD7 417 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 GCNT2Q8N0V5 402 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SPATA6LQ8N4H0 392 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CD200R1Q8TD46 325 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CANT1Q8WVQ1 401 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 LRTOMTQ8WZ04 291 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 TUBGCP3Q96CW5 907 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 OR2A5Q96R48 311 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RASL10BQ96S79 203 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 BCL7BQ9BQE9 202 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 UGT2B28Q9BY64 529 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 NUAK2Q9H093 628 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 MAGIXQ9H6Y5 334 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 FANCFQ9NPI8 374 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 USE1Q9NZ43 259 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF225Q9UK10 706 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 TMED5Q9Y3A6 229 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ATG4BQ9Y4P1 393 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CCL27Q9Y4X3 112 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 OARD1Q9Y530 152 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ARL5AQ9Y689 179 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CEPT1Q9Y6K0 416 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 HEATR5AQ86XA9 2040 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SLC5A10A0PJK1 596 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SLC22A23A1A5C7 686 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 FRG2CA6NGY1 282 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 DLGAP1O14490 977 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 RGS14O43566 566 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 UGDHO60701 494 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 TRMUO75648 421 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CSF3P09919 207 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 PRPS2P11908 318 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CHMP24386 653 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 FMO4P31512 558 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GSK3BP49841 420 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRK-211ENST00000429595 CDH13P55290 713 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SRYQ05066 204 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 LIPEQ05469 1076 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC74AQ0VAA2 488 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GRB7Q14451 532 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 TGFBIQ15582 683 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC36Q1X8D7 754 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 RFX4Q33E94 735 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 VPS26BQ4G0F5 336 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CTSL3PQ5NE16 218 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 LRIF1Q5T3J3 769 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 TTC23Q5W5X9 447 aa5.46□□□□□ -1.54
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