RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf10Q5SRN2 563 aa18.35■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 CREB3L2Q70SY1 520 aa18.35■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINA11Q86U17 422 aa18.35■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ADPRHL2Q9NX46 363 aa18.35■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 FTCDNL1E5RQL4 147 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 CSF3P09919 207 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A16P16260 332 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 CHRNB3Q05901 458 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF311Q5JNZ3 666 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf89Q6UWU4 347 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HIPK1Q86Z02 1210 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 MFSD8Q8NHS3 518 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 BBS10Q8TAM1 723 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 C12orf10Q9HB07 376 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 TMBIM4Q9HC24 238 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM45AQ9NWC5 275 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ATP23Q9Y6H3 246 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa18.33■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF587BE7ETH6 402 aa18.33■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 CLIC1O00299 241 aa18.33■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 AHSA1O95433 338 aa18.33■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 C3orf36Q3SXR2 165 aa18.33■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 EPGNQ6UW88 154 aa18.33■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 ANKK1Q8NFD2 765 aa18.33■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 OR1K1Q8NGR3 316 aa18.33■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA3Q8NHX4 192 aa18.33■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00470Q9BZP3 86 aa18.33■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 GMEB1Q9Y692 573 aa18.33■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 ABCA1O95477 2261 aa18.33■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 ETS2P15036 469 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 SELENOPP49908 381 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 EFNA4P52798 201 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 VLDLRP98155 873 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 EGR4Q05215 589 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 TBRG1Q3YBR2 411 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 HIKESHIQ53FT3 197 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 LRIF1Q5T3J3 769 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf46Q6UWT4 87 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 EPHX4Q8IUS5 362 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF525Q8N782 197 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 C7orf26Q96N11 449 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 KATNB1Q9BVA0 655 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 PTDSS2Q9BVG9 487 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 RCE1Q9Y256 329 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 USH1CQ9Y6N9 552 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 SONP18583 2426 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 A8MV72 311 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 ERLIN1O75477 346 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 KRT33AO76009 404 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 TGDSO95455 350 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT7P0C024 238 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 PNMTP11086 282 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 PRKAR1BP31321 381 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 SWI5Q1ZZU3 235 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM249Q2WGJ8 235 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf52Q5T4I8 152 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 SLC2A7Q6PXP3 512 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 FAM169BQ8N8A8 192 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 LSMEM1Q8N8F7 131 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf105Q8TEF2 133 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 FAM168AQ92567 244 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 PROX1Q92786 737 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 SLC38A2Q96QD8 506 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 YAE1D1Q9NRH1 226 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 MOKQ9UQ07 419 aa18.31■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa18.3■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 STX1BP61266 288 aa18.3■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 NIPAL3Q6P499 406 aa18.3■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 PODNL1Q6PEZ8 512 aa18.3■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 MAL2Q969L2 176 aa18.3■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM160Q9NX00 188 aa18.3■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 OR2T1O43869 369 aa18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 GPRIN2O60269 458 aa18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 PDE5AO76074 875 aa18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF432O94892 652 aa18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 LGI1O95970 557 aa18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 F12P00748 615 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 ARAFP10398 606 aa18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 PPIBP23284 216 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
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