RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 GSTA4O15217 222 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 IGHV1-2P23083 117 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 PRDX6P30041 224 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 PSME3P61289 254 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXW9Q5XUX1 488 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 TPD52L3Q96J77 140 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 PARPBPQ9NWS1 579 aa22.1■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC168Q8NDH2 2452 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PPR1 153 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 OR2T1O43869 369 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 THY1P04216 161 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 GRPRP30550 384 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 OR1E2P47887 323 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 GSK3BP49841 420 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM69AQ5T7M9 428 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 C5orf46Q6UWT4 87 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 AAED1Q7RTV5 226 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 C10orf53Q8N6V4 93 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 RASD1Q9Y272 281 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 CSMD2Q7Z408 3487 aa22.09■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 MYO9AB2RTY4 2548 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 TRAPPC13A5PLN9 417 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 M0R082 166 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 VAMP5O95183 116 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 GOSR1O95249 250 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 LYPD3O95274 346 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 LTBQ06643 244 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 FAPQ12884 760 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 DEF8Q6ZN54 512 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 CREB3L2Q70SY1 520 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF417Q8TAU3 575 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 EPYCQ99645 322 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 OR10A4Q9H209 315 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 UPB1Q9UBR1 384 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC7A7Q9UM01 511 aa22.08■■□□□ 1.13
HTATSF1-202ENST00000425695 CSMD1Q96PZ7 3565 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRN3E7EW58 273 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 CXCR6O00574 342 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 KLF4O43474 513 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 CHP2O43745 196 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 IL1RL1Q01638 556 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 STK11Q15831 433 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 TSPO2Q5TGU0 170 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 LINC00114Q6XXX2 140 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR88Q6ZMY6 472 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM45BQ96B21 275 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM43Q9BTV4 400 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 ALG2Q9H553 416 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC7A10Q9NS82 523 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 ARL8BQ9NVJ2 186 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 ASB6Q9NWX5 421 aa22.07■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 DCTN3O75935 186 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 BGLAPP02818 100 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 TAB1Q15750 504 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 C9orf135Q5VTT2 229 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 EPHX4Q8IUS5 362 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 MOGAT1Q96PD6 335 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 HS3ST6Q96QI5 342 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHAC1Q9H158 963 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 ADA2Q9NZK5 511 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 CIB4A0PJX0 185 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 NQO1P15559 274 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 NCK1P16333 377 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 COX5AP20674 150 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 TAS2R41P59536 307 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 SELENOWP63302 87 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 HSD17B8Q92506 261 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC41A3Q96GZ6 507 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 OXGR1Q96P68 337 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 NDUFAB1O14561 156 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 RAD51DO75771 328 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF682O95780 498 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF43P17038 809 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 GGT1P19440 569 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 SELENOPP49908 381 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 CLDN17P56750 224 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 C1DQ13901 141 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 BEX5Q5H9J7 111 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 VTCN1Q7Z7D3 282 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF148Q8N7C7 305 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 OR6S1Q8NH40 331 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-202ENST00000425695 LZICQ8WZA0 190 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.5 ms