RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422465.6

RPS3-202, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 2

Gene RPS3, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-202ENST00000422465 OR51A7Q8NH64 312 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 OR4C6Q8NH72 309 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 SLC46A1Q96NT5 459 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 TEAD3Q99594 435 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 ATMQ13315 3056 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 COL6A6A6NMZ7 2263 aa9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 DAPL1A0PJW8 107 aa9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 SEC14L5O43304 696 aa9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 OR2B3O76000 313 aa9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 OR7A10O76100 309 aa9.49□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 IGKV3-11P04433 115 aa9.49□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 SLC37A1P57057 533 aa9.49□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 TAS2R43P59537 309 aa9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 ACTC1P68032 377 aa9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 ACTA1P68133 377 aa9.49□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 ZNF85Q03923 595 aa9.49□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 NDUFAF6Q330K2 333 aa9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 KLHL12Q53G59 568 aa9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 DDI2Q5TDH0 399 aa9.49□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 TMEM91Q6ZNR0 172 aa9.49□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 GATAD2AQ86YP4 633 aa9.49□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 OR4C3Q8NH37 302 aa9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 LIPHQ8WWY8 451 aa9.49□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 DDOQ99489 341 aa9.49□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.49□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.49□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 ARPC3O15145 178 aa9.48□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 DDAH2O95865 285 aa9.48□□□□□ -0.89
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RPS3-202ENST00000422465 PNMTP11086 282 aa9.48□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 RORAP35398 523 aa9.48□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 DCAF7P61962 342 aa9.48□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 PPP3R1P63098 170 aa9.48□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 SKP2Q13309 424 aa9.48□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 KCNAB1Q14722 419 aa9.48□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 NNATQ16517 81 aa9.48□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 LCN1P1Q5VSP4 162 aa9.48□□□□□ -0.89
RPS3-202ENST00000422465 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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