RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 HMGB4Q8WW32 186 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 PTTG3PQ9NZH4 202 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF281Q9Y2X9 895 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 EML5Q05BV3 1969 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1B0GTQ1 180 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM127O75204 238 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 PGDP52209 483 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ERV3-1Q14264 604 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 SLC35F3Q8IY50 421 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 FRMD1Q8N878 549 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ACTR6Q9GZN1 396 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 IMPA2O14732 288 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 GRK6P43250 576 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ARPC4P59998 168 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 C1orf61Q13536 156 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 FZD2Q14332 565 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 CMTM4Q8IZR5 234 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ORAI3Q9BRQ5 295 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 CLDN16Q9Y5I7 305 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 IGF2P01344 180 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 CCR5P51681 352 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 CCR6P51684 374 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ELOA3BQ3SY89 546 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 KLHL26Q53HC5 615 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 LEG1Q6P5S2 330 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 PRSS45Q7RTY3 260 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 LUZP2Q86TE4 346 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ELOA3Q8NG57 546 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 MOSPD2Q8NHP6 518 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 MMP17Q9ULZ9 603 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 MPDZO75970 2070 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 PIN1P1O15428 100 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 NSA2O95478 260 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 MT-ND4P03905 459 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 THEGLP0DJG4 465 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 GSG1Q2KHT4 349 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 LINC01590Q5TEZ4 76 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 KIAA0895LQ68EN5 471 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 SLC6A19Q695T7 634 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 DERL3Q96Q80 235 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ALG12Q9BV10 488 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ZFP64Q9NPA5 681 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 RXFP3Q9NSD7 469 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 C2orf42Q9NWW7 574 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 UCKL1Q9NWZ5 548 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 AIPO00170 330 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 NDUFB5O43674 189 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 PNMTP11086 282 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 GDNFP39905 211 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 WBP2NLQ6ICG8 309 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 CDH24Q86UP0 819 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 JAZF1Q86VZ6 243 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF615Q8N8J6 731 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 GPR137Q96N19 417 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 PLEKHA1Q9HB21 404 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 PRODH2Q9UF12 536 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 SLC6A5Q9Y345 797 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 IFITM5A6NNB3 132 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 WNT1P04628 370 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD34CP0C6C1 535 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 MAOAP21397 527 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 SLC25A1P53007 311 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 IZUMO1Q8IYV9 350 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF527Q8NB42 609 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 OR56B4Q8NH76 319 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 GFI1Q99684 422 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 MGAT4AQ9UM21 535 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 B4DGG1 531 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ITGA10O75578 1167 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF684Q5T5D7 378 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 HES5Q5TA89 166 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 FAM71CQ8NEG0 241 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 LIPHQ8WWY8 451 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 TCTN2Q96GX1 697 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 Q96M85 177 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 AUNIPQ9H7T9 357 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 SLC23A1Q9UHI7 598 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 HIF3AQ9Y2N7 669 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 RNF215Q9Y6U7 377 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 ACOD1A6NK06 481 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 IFNA16P05015 189 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 TACSTD2P09758 323 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 HSD17B7P56937 341 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 FAM69AQ5T7M9 428 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD13-201ENST00000392539 LINGO2Q7L985 606 aa24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms