RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384622.1

RNU6-540P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 540, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-540P, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-540P-201ENST00000384622 SLC25A46Q96AG3 418 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 WDR34Q96EX3 536 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 SDSLQ96GA7 329 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 P2RX4Q99571 388 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 TXNDC17Q9BRA2 123 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 GNB1LQ9BYB4 327 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 CHST5Q9GZS9 411 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 DPAGT1Q9H3H5 408 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 HRH4Q9H3N8 390 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 PLK3Q9H4B4 646 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 HAO2Q9NYQ3 351 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 EHD2Q9NZN4 543 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 FETUBQ9UGM5 382 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 PILRBQ9UKJ0 227 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 PRKAB1Q9Y478 270 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 GMPPBQ9Y5P6 360 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 FRMPD4Q14CM0 1322 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZBED9Q6R2W3 1325 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 DENND4CQ5VZ89 1909 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A1W2PRM7 423 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 HTR3EA5X5Y0 456 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 LGALS16A8MUM7 142 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 TMCO5BA8MYB1 307 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 CHUKO15111 745 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 CLOCKO15516 846 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 TGOLN2O43493 480 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 XRCC3O43542 346 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 SLC37A4O43826 429 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 SPINK4O60575 86 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 RFPL1O75677 317 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 MYO1DO94832 1006 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR4F21O95013 312 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 CPNE6O95741 557 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 GSRP00390 522 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 PGK1P00558 417 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 GZMBP10144 247 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 COX7A2P14406 83 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 XBP1P17861 261 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 PGAM1P18669 254 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 ACP1P24666 158 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 CHMLP26374 656 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 PPP2R1AP30153 589 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 VAMP7P51809 220 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 FOXA1P55317 472 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 ENPEPQ07075 957 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 KLKP1Q107X0 134 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 IKQ13123 557 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 MORC3Q14149 939 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 CHRNA6Q15825 494 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 FAM229BQ4G0N7 80 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 ACSM3Q53FZ2 586 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 SYT14P1Q58G82 188 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 SOHLH1Q5JUK2 328 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 ANKRD45Q5TZF3 282 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 FAM91A1Q658Y4 838 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 KCTD16Q68DU8 428 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 NXNQ6DKJ4 435 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR4F3Q6IEY1 312 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR4A47Q6IF82 309 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 FAM220AQ7Z4H9 259 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 TPRA1Q86W33 373 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 ECHDC2Q86YB7 292 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 PGAM4Q8N0Y7 254 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 BATF2Q8N1L9 274 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 ELMOD1Q8N336 334 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 LRRC17Q8N6Y2 441 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 CLDN22Q8N7P3 220 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 NECAP1Q8NC96 275 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR4C6Q8NH72 309 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 SSMEM1Q8WWF3 244 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 UCN3Q969E3 161 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-540P-201ENST00000384622 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
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