RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 OR51L1Q8NGJ5 315 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 YIPF5Q969M3 257 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 PEX11GQ96HA9 241 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC3Q9BQI4 270 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 SLC6A15Q9H2J7 730 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 PRDM9Q9NQV7 894 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 WDPCPO95876 746 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 PEPDP12955 493 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 CD53P19397 219 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 NPR2P20594 1047 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 PLAURQ03405 335 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ALG11Q2TAA5 492 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ALG10BQ5I7T1 473 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 FAM198BQ6UWH4 519 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 SSX6Q7RTT6 188 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 OR52E2Q8NGJ4 325 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 OR4K13Q8NH42 304 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 FLVCR2Q9UPI3 526 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0B4J2E0 115 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 A0A1B0GX12 115 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 A6NCN8 305 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 OR5K4A6NMS3 321 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 PDCD5O14737 125 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 RDH16O75452 317 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 RAB3BP20337 219 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 SLC2A5P22732 501 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 NRG3P56975 720 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 TFF2Q03403 129 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 Q6ZTK2 550 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 SFTPA2Q8IWL1 248 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 SDR9C7Q8NEX9 313 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 OR4N2Q8NGD1 307 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ASB12Q8WXK4 309 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 PFDN2Q9UHV9 154 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 TRANK1O15050 2925 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 MYO9BQ13459 2157 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 L7N2F9 121 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 CBX7O95931 251 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 WNT1P04628 370 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 NGFRP08138 427 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 RPL35P42766 123 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ACTC1P68032 377 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ACTA1P68133 377 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 BTN2A1Q7KYR7 527 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 RFLNBQ8N5W9 214 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 CLRN3Q8NCR9 226 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 BVESQ8NE79 360 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 PGLYRP3Q96LB9 341 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ZFP3Q96NJ6 502 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 FANCMQ8IYD8 2048 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0G2JK05 382 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ADAM11O75078 769 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 NKX2-2O95096 273 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 TFP02787 698 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 FGF2P09038 288 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 PBX2P40425 430 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 MAP3K8P41279 467 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 AKR1D1P51857 326 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 PYHIN1Q6K0P9 492 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 SYT9Q86SS6 491 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 THAP4Q8WY91 577 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 PIGKQ92643 395 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 DMRTA2Q96SC8 542 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM2Q9C040 744 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 C20orf85Q9H1P6 137 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 FBRSQ9HAH7 460 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 MED9Q9NWA0 146 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 COPZ2Q9P299 210 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0B4J203 849 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 FAM74A7A6NL05 159 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 GATBO75879 557 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 APOC3P02656 99 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 PPP1CAP62136 330 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 POU4F2Q12837 409 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-202ENST00000375175 DEFB110Q30KQ9 67 aa12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms