RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369838.5

SH3BGRL2-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL2, Length 4,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FZD2Q14332 565 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TCTN3Q6NUS6 607 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ARSKQ6UWY0 536 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LRRN1Q6UXK5 716 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GFRALQ6UXV0 394 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DPY19L4Q7Z388 723 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 WFDC8Q8IUA0 241 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLC41A2Q96JW4 573 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRIB1Q96RU8 372 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MICU1Q9BPX6 476 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TEX101Q9BY14 249 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TUBB1Q9H4B7 451 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MED20Q9H944 212 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF224Q9NZL3 707 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MBD2Q9UBB5 411 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CACNA1AO00555 2505 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 WDR90Q96KV7 1748 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SEC14L2O76054 403 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 OR8G3PP0DMU2 310 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MAKP20794 623 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 EMP3P54852 163 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 BDH1Q02338 343 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 COL28A1Q2UY09 1125 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ABRACLQ9P1F3 81 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NEU3Q9UQ49 428 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TMEM72A0PK05 275 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CXCL13O43927 109 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLITRK5O94991 958 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MFAP5Q13361 173 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GAB1Q13480 694 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CBLL1Q75N03 491 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRILQ7L0X0 811 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF367Q7RTV3 350 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF554Q86TJ5 538 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF709Q8N972 641 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 OR5D18Q8NGL1 313 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 OR5M9Q8NGP3 310 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LGALS12Q96DT0 336 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ABCA7Q8IZY2 2146 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DSCR3O14972 297 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PTHP01270 115 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TFPTP0C1Z6 253 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CISD3P0C7P0 127 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PIGAP37287 484 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TUBA1BP68363 451 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PSPHP78330 225 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TUBA1AQ71U36 451 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 OR6T1Q8NGN1 323 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CITED4Q96RK1 184 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 POTEKPQ9BYX7 375 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 P4HTMQ9NXG6 502 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GLSO94925 669 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLC36A2Q495M3 483 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TMEM244Q5VVB8 128 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HSD17B8Q92506 261 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NMNAT3Q96T66 252 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLC6A15Q9H2J7 730 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LYRM4Q9HD34 91 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ASB1Q9Y576 335 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CADP27708 2225 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HPRP00739 348 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLC2A1P11166 492 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GPR3P46089 330 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TUBA3CQ13748 450 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TCTN1Q2MV58 587 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CD300LGQ6UXG3 332 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SERPINA12Q8IW75 414 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CHTF18Q8WVB6 975 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLC19A3Q9BZV2 496 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CORINQ9Y5Q5 1042 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 A0A1B0GTL3 188 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 A8MVM7 634 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FZD6O60353 706 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KNG1P01042 644 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IFNGR1P15260 489 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ART1P52961 327 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IL10RAQ13651 578 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ANKRD34AQ69YU3 496 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FAM71E1Q6IPT2 247 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CYHR1Q6ZMK1 362 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF511Q8NB15 262 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 B3GNT7Q8NFL0 401 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 OR7G1Q8NGA0 311 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 OR4F15Q8NGB8 312 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FNDC8Q8TC99 324 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms