RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 SPINK2P20155 84 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 AKR1D1P51857 326 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 TAS2R39P59534 338 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 GUCA2BQ16661 112 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ZBED5Q49AG3 693 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 KRTCAP3Q53RY4 240 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 P2RY8Q86VZ1 359 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 GABRG1Q8N1C3 465 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 LRRC57Q8N9N7 239 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 OR51G2Q8NGK0 314 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 FCGR1BQ92637 280 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 RPEQ96AT9 228 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 PIK3IP1Q96FE7 263 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 MS4A4EQ96PG1 132 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 MKLN1Q9UL63 735 aa3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SLC22A31A6NKX4 558 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 VNN1O95497 513 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 LIPCP11150 499 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 MAGP20916 626 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ZNF460Q14592 562 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 TGFBIQ15582 683 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 GSG1Q2KHT4 349 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 PLA1AQ53H76 456 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 GPR107Q5VW38 600 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 OR5AR1Q8NGP9 310 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 OLIG1Q8TAK6 271 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 TNFRSF25Q93038 417 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 TOMM40LQ969M1 308 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SARGQ9BW04 601 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 MS4A5Q9H3V2 200 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 EVA1AQ9H8M9 152 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 KIF25Q9UIL4 384 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 POMT2Q9UKY4 750 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 BTAF1O14981 1849 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ATRXP46100 2492 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 C21orf140B9A014 251 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 PIRO00625 290 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SH2D1BO14796 132 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 GPR137BO60478 399 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 RPS18P62269 152 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CLN3Q13286 438 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 BEST3Q8N1M1 668 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 OR52N2Q8NGI0 321 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 PYURFQ96I23 114 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 IL4I1Q96RQ9 567 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 DKK3Q9UBP4 350 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ECM29Q5VYK3 1845 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 E9PQ18 207 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 TXNDC12O95881 172 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 OR8U9P0C7N5 309 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 Q56UQ5 140 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 GGNBP1Q5YKI7 109 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 PYDC1Q8WXC3 89 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ATG101Q9BSB4 218 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 FUCA2Q9BTY2 467 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ACSS3Q9H6R3 686 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 THYN1Q9P016 225 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ZNF716A6NP11 495 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 GLAP06280 429 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 OR4A8P0C604 315 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 FUT1P19526 365 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SERPINA2P20848 420 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 ZNF83P51522 516 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 MLLT10P55197 1068 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 MTCP1P56278 107 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 RAB38P57729 211 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 SLC25A3Q00325 362 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 AGERQ15109 404 aa3.82□□□□□ -1.8
CENPF-201ENST00000366955 CLLU1OSQ5K130 101 aa3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms