RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf111Q8N326 155 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 OR2T12Q8NG77 320 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 LZICQ8WZA0 190 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 HSD17B8Q92506 261 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ADAM19Q9H013 955 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 IKZF5Q9H5V7 419 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 NGBQ9NPG2 151 aa6.77□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 MALT1Q9UDY8 824 aa6.77□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CADP27708 2225 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 LIPT2A6NK58 231 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 A8MVM7 634 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 FXYD1O00168 92 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 HS3ST1O14792 307 aa6.76□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF9O43307 516 aa6.76□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 RAD51DO75771 328 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 AKR7A3O95154 331 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CD3EP07766 207 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 GGT1P19440 569 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CALB2P22676 271 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV1-2P23083 117 aa6.76□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 IFNA8P32881 189 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 MXRA7P84157 204 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 HOXC5Q00444 222 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 BSPH1Q075Z2 132 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 BNIP2Q12982 314 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CEACAM7Q14002 265 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PPA1Q15181 289 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 OR7A5Q15622 319 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ADRM1Q16186 407 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 VMACQ2NL98 169 aa6.76□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.76□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 P3H2Q8IVL5 708 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 OR10A6Q8NH74 314 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 C3orf49Q96BT1 292 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 MUCL1Q96DR8 90 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PERPQ96FX8 193 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM2Q9C040 744 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 DLL4Q9NR61 685 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ASB6Q9NWX5 421 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.75□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 AQP7P3A6NL99 342 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 AHSA1O95433 338 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 FOSL1P15407 271 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 AQP1P29972 269 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 NTF4P34130 210 aa6.75□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PSME3P61289 254 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 FAPQ12884 760 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SLC17A1Q14916 467 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 RABL3Q5HYI8 236 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SHEQ5VZ18 495 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.75□□□□□ -1.33
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