RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 IGHEP01854 428 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 TSPAN31Q12999 210 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 ESCO2Q56NI9 601 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 CDCP1Q9H5V8 836 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 NXPH3O95157 252 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SLC35A1P78382 337 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 OR13C9Q8NGT0 318 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM255BQ8WV15 326 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 HRASLSQ9HDD0 168 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 NGBQ9NPG2 151 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 FGF21Q9NSA1 209 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 DUSP13Q9UII6 198 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 RCE1Q9Y256 329 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF749O43361 778 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 RRADP55042 308 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 HBMQ6B0K9 141 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 ALG12Q9BV10 488 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SGPP1Q9BX95 441 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 RFPL3O75679 317 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 ITGB2P05107 769 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 BCL6P41182 706 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A7Q9Y694 548 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 TK1P04183 234 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 TPT1P13693 172 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SPCS2Q15005 226 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 RPS25P62851 125 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 BATFQ16520 125 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SGK3Q96BR1 496 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 DPM1O60762 260 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 FAM174AQ8TBP5 190 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 P2RY10O00398 339 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 PRAF2O60831 178 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 MAKP20794 623 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF91Q05481 1191 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 TM4SF18Q96CE8 201 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 CXorf36Q9H7Y0 433 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 RAB27BO00194 218 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 DAPP51397 102 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 LINC01553A4QN01 128 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 CYB5BO43169 146 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 FURINP09958 794 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SLC36A2Q495M3 483 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 OR4N2Q8NGD1 307 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SPHK1Q9NYA1 384 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 CD300AQ9UGN4 299 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 FUOMA2VDF0 154 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 CCSMST1Q4G0I0 132 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF597Q96LX8 424 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 PRR14Q9BWN1 585 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 H0YIV9 168 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 KLKB1P03952 638 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 PRKAR1BP31321 381 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SEMA3BQ13214 749 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 RTL6Q6ICC9 239 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SUMF2Q8NBJ7 301 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 WFDC5Q8TCV5 224 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 NXPE3Q969Y0 559 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 PIGQQ9BRB3 760 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A31Q9H0C2 315 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 TAS2R16Q9NYV7 291 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1B0GTW7 788 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 GGTA1PQ4G0N0 100 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 PARP16Q8N5Y8 322 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 PDXPQ96GD0 296 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 UBXN10Q96LJ8 280 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 EVA1AQ9H8M9 152 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 GHRLQ9UBU3 117 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 NOXA1Q86UR1 476 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SELENOIQ9C0D9 397 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 CDHR4A6H8M9 788 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 MCRIP1C9JLW8 97 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 GABRB3P28472 473 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 KCNAB1Q14722 419 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 DUSP7Q16829 419 aa20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms