RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC32Q9BV29 185 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 TTTY10Q9BZA0 68 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 SIGLEC7Q9Y286 467 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF749O43361 778 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 LALBAP00709 142 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 CLUP10909 449 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 SDC2P34741 201 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 CXCL12P48061 93 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 MED25Q71SY5 747 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF550Q7Z398 422 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC36Q8IYA8 594 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCTD7Q96MP8 289 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 DPYSL5Q9BPU6 564 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 ALPK2Q86TB3 2170 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 FABP12A6NFH5 140 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPS5P46782 204 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 INPP1P49441 399 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 TCTE3Q8IZS6 198 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 BARHL1Q9BZE3 327 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 EPHA6Q9UF33 1036 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 LYPD3O95274 346 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 GABRA4P48169 554 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 CAV3P56539 151 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 HSD11B2P80365 405 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 RIN1Q13671 783 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 VWA2Q5GFL6 755 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATRAIDQ6UW56 229 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 STPG2Q8N412 459 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR51L1Q8NGJ5 315 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 NDC1Q9BTX1 674 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 NRSN2Q9GZP1 204 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRDM6Q9NQX0 595 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRODH2Q9UF12 536 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 FBXL4Q9UKA2 621 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 CLDN16Q9Y5I7 305 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 A3GALT2U3KPV4 340 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 DAPL1A0PJW8 107 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 DUX1O43812 170 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 HPGDSO60760 199 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 SOX30O94993 753 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 NGFRP08138 427 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 SERTAD2Q14140 314 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 RNLSQ5VYX0 342 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 GID4Q8IVV7 300 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC35F3Q8IY50 421 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 DNAJA3Q96EY1 480 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 UCK1Q9HA47 277 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 WDFY4Q6ZS81 3184 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 SERINC4A6NH21 518 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 BHLHE40O14503 412 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 TO15178 435 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 TBXA2RP21731 343 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 F8A1P23610 371 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 LIMK1P53667 647 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 DMWDQ09019 674 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 CRMP1Q14194 572 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 ULK3Q6PHR2 472 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLXDC1Q8IUK5 500 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 LRRC17Q8N6Y2 441 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 CLDN22Q8N7P3 220 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 PMM1Q92871 262 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 RELTQ969Z4 430 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 WNT16Q9UBV4 365 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 MLXQ9UH92 298 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 CACNG2Q9Y698 323 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 CASKO14936 926 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF806P0C7X5 589 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 DEFA5Q01523 94 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 INSL4Q14641 139 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLK5Q496M5 336 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 ACBD7Q8N6N7 88 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 C19orf18Q8NEA5 215 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR4K13Q8NH42 304 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM131Q92545 1883 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 H0YIG0 161 aa19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms