RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 EMP2P54851 167 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 LTBQ06643 244 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 CDONQ4KMG0 1287 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 JAZF1Q86VZ6 243 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 LAX1Q8IWV1 398 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 HIST1H2ACQ93077 130 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF524Q96C55 264 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 LPAR4Q99677 370 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 USP34Q70CQ2 3546 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 SEC16AO15027 2179 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 OR6C68A6NDL8 312 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 PRR33A8MZF0 331 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 RANBP1P43487 201 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 HTR3AP46098 478 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 CTXN1P60606 82 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 SLC35F2Q8IXU6 374 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 MS4A15Q8N5U1 240 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 OR5L2Q8NGL0 311 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 KLHL1Q9NR64 748 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 J3QLW9 94 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 TFP02787 698 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 BGLAPP02818 100 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF19P17023 458 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 PPP3R1P63098 170 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM205Q6UW68 189 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 GRINAQ7Z429 371 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM105Q8N8V8 129 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 SETD6Q8TBK2 473 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 GPR119Q8TDV5 335 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 TAAR8Q969N4 342 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 RASD2Q96D21 266 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 TMCO6Q96DC7 493 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 SLC25A12O75746 678 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 OR12D2P58182 307 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 DAB2P98082 770 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 LEG1Q6P5S2 330 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 SLC23A3Q6PIS1 610 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 POC5Q8NA72 575 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 Q96M85 177 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 SPSB2Q99619 263 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 ABCB9Q9NP78 766 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 MYO15AQ9UKN7 3530 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 CD8B2A6NJW9 211 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 ADAM10O14672 748 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 OGG1O15527 345 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 NPIPB7O75200 414 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 SC5DO75845 299 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 NUDT14O95848 222 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 CD8BP10966 210 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 TGM4P49221 684 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 DNASE1L3Q13609 305 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 QPRTQ15274 297 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 GXYLT1Q4G148 440 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC58Q4VC31 144 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 MZT2AQ6P582 158 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 PAMR1Q6UXH9 720 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 EXD3Q8N9H8 876 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 TEX19Q8NA77 164 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 OR6S1Q8NH40 331 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 STK35Q8TDR2 534 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 RNF138Q8WVD3 245 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM234Q8WY98 164 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 ACOT12Q8WYK0 555 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 MIXL1Q9H2W2 232 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 TAS2R10Q9NYW0 307 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 FBXO4Q9UKT5 387 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 DMDP11532 3685 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 SERPINA3P01011 423 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 SYPP08247 313 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
HOXD9-201ENST00000249499 DLX5P56178 289 aa20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms