RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 OR9K2Q8NGE7 335 aa19.74■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 LZICQ8WZA0 190 aa19.74■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 FAM162AQ96A26 154 aa19.74■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 MPP4Q96JB8 637 aa19.74■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 HSH2DQ96JZ2 352 aa19.74■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 MOGAT1Q96PD6 335 aa19.74■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 NDE1Q9NXR1 346 aa19.74■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 B3GAT1Q9P2W7 334 aa19.74■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 ALPK2Q86TB3 2170 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 C16orf97H3BN30 126 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 M0R082 166 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 GPR171O14626 319 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 EPXP11678 715 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 CBLP22681 906 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 GRPRP30550 384 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 NHLRC1Q6VVB1 395 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 EPHX4Q8IUS5 362 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 KDM8Q8N371 416 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 FAM86B1Q8N7N1 296 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 ZNF417Q8TAU3 575 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 FAM222BQ8WU58 562 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 SLC24A3Q9HC58 644 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R1Q9NYW7 299 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 EMC3Q9P0I2 261 aa19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 MS4A18H0YCH9 400 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 J3KTA2 159 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 PRSS23O95084 383 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 VAMP5O95183 116 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP10-9P60411 292 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 MXRA7P84157 204 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 POU4F3Q15319 338 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 MS4A18Q3C1V0 323 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 SPATS1Q496A3 300 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 IFI44LQ53G44 452 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 TMEM225Q6GV28 225 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 CREB3L2Q70SY1 520 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 STK32CQ86UX6 486 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 TMEM45BQ96B21 275 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 DACH2Q96NX9 599 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 EPYCQ99645 322 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 RASD1Q9Y272 281 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 TESMINQ9Y4I5 508 aa19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 UBOX5O94941 541 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 ADAP00813 363 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 YAP1P46937 504 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 UGT2B15P54855 530 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R41P59536 307 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 TLE4Q04727 773 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 IQCCQ4KMZ1 466 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD34AQ69YU3 496 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZT83 130 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 TMEM255BQ8WV15 326 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 C7orf34Q96L11 122 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 PRRC1Q96M27 445 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 KLHL4Q9C0H6 718 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 C1orf21Q9H246 121 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 ABCA4P78363 2273 aa19.71■□□□□ 0.75
SYF2-201ENST00000236273 NAV2Q8IVL1 2488 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 CSMD2Q7Z408 3487 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 LRBAP50851 2863 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 SH3D21A4FU49 640 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 ARPC2O15144 300 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 HPRP00739 348 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 IFNW1P05000 195 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 THRBP10828 461 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 SSTR2P30874 369 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 TSC22D1Q15714 1073 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 ZNF74Q16587 644 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 SFRP5Q5T4F7 317 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 FKBP9P1Q75LS8 142 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 GPAT4Q86UL3 456 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 SLC19A3Q9BZV2 496 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 MCCC2Q9HCC0 563 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 RPS6KA6Q9UK32 745 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 PDZD2O15018 2839 aa19.7■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 CSMD1Q96PZ7 3565 aa19.69■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-9P01782 118 aa19.69■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 SEMG1P04279 462 aa19.69■□□□□ 0.74
SYF2-201ENST00000236273 THBDP07204 575 aa19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 190.9 ms