RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641601.1

SAMMSON-218, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,847 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-218ENST00000641601 OR5T3Q8NGG3 340 aa9.3□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 OR10G6Q8NH81 332 aa9.3□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.3□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.3□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 NXPE2Q96DL1 559 aa9.3□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 DHRS9Q9BPW9 319 aa9.3□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.3□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9.3□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF281Q9Y2X9 895 aa9.3□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 NUP210LQ5VU65 1888 aa9.3□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 LRP4O75096 1905 aa9.3□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 A0A087WUJ7 227 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 A0A0J9YY10 115 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 A0A1B0GUH1 482 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 IFITM5A6NNB3 132 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 SSNA1O43805 119 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 IGF2P01344 180 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 IGKV1D-16P01601 117 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 DPP4P27487 766 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 GDI1P31150 447 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 MNDAP41218 407 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 SRP54P61011 504 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 CLLU1Q5K131 121 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 METTL11BQ5VVY1 283 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC6A19Q695T7 634 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 KIRREL2Q6UWL6 708 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 PRSS45Q7RTY3 260 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 RD3Q7Z3Z2 195 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 HDDC2Q7Z4H3 204 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC35F3Q8IY50 421 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 CSNK1A1LQ8N752 337 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF614Q8N883 585 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 NPEPL1Q8NDH3 523 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 C15orf40Q8WUR7 153 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 BMFQ96LC9 184 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 GFI1Q99684 422 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 HRASLSQ9HDD0 168 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 NOX4Q9NPH5 578 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 ANKRD10Q9NXR5 420 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 KLHL9Q9P2J3 617 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 FBXL3Q9UKT7 428 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.29□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 PIN1P1O15428 100 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 OR10H2O60403 315 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 KRT33AO76009 404 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 GLCEO94923 617 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 RASGRP1O95267 797 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 CALCBP10092 127 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 MYOGP15173 224 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 SPI1P17947 270 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 LSSP48449 732 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 ZP1P60852 638 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 SNTA1Q13424 505 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 TOR2AQ5JU69 321 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 OLFML2AQ68BL7 652 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 IDO2Q6ZQW0 420 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 LINGO2Q7L985 606 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 OR8H3Q8N146 312 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 OR6V1Q8N148 313 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 SPICQ8N5J4 248 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC25A38Q96DW6 304 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 ARSGQ96EG1 525 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 HSPA12BQ96MM6 686 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 VSTM2LQ96N03 204 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 DERL3Q96Q80 235 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 KXD1Q9BQD3 176 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 G6PC3Q9BUM1 346 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 TTTY10Q9BZA0 68 aa9.28□□□□□ -0.92
SAMMSON-218ENST00000641601 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms