RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635865.1

ATRX-220, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-220ENST00000635865 MS4A12Q9NXJ0 267 aa2.13□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 EURLQ9NYK6 297 aa2.13□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 EMC3Q9P0I2 261 aa2.13□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa2.13□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ERVW-1Q9UQF0 538 aa2.13□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa2.13□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 POFUT2Q9Y2G5 429 aa2.13□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 JCADQ9P266 1359 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 USP6P35125 1406 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 A0A1W2PRF3 423 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 A0A1W2PRM7 423 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 MGAT4DA6NG13 374 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 MSGN1A6NI15 193 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 OR5B21A6NL26 309 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 NPIPB8E9PQR5 432 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 H7C0C1 242 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ITGB1BP1O14713 200 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 HSD17B6O14756 317 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 PPP1R2P9O14990 202 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SOX15O60248 233 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 GMDSO60547 372 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SLC19A2O60779 497 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 RAMP2O60895 175 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ENTPD5O75356 428 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ZMPSTE24O75844 475 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 VAPBO95292 243 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 TSPAN13O95857 204 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 FADS2O95864 444 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 TSHBP01222 138 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 LGALS2P05162 132 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 KRT16P08779 473 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 HSD17B1P14061 328 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SDC1P18827 310 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 BGNP21810 368 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 GABRR2P28476 465 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CSKP41240 450 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 YAP1P46937 504 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 HAAOP46952 286 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 POU3F4P49335 361 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ARHGDIBP52566 201 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ATP5J2P56134 94 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 RIPK4P57078 832 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 RPL8P62917 257 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 DHODHQ02127 395 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 PAX2Q02962 417 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ZNF33AQ06730 810 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ZNF154Q13106 437 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 PMS2P3Q13401 168 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ART3Q13508 389 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 OR5I1Q13606 314 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 DMC1Q14565 340 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 TEAD2Q15562 447 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ZIC1Q15915 447 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 UPP1Q16831 310 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CYP51A1Q16850 503 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 HLA-BQ31612 363 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 TIGITQ495A1 244 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SOHLH1Q5JUK2 328 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ZNF836Q6ZNA1 936 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 Q6ZPA2 131 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ZNF621Q6ZSS3 439 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 FAM122BQ7Z309 247 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CMC1Q7Z7K0 106 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SLC26A11Q86WA9 606 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ZBED8Q8IZ13 594 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SLC39A11Q8N1S5 342 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CSNK1A1LQ8N752 337 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ZNF781Q8N8C0 355 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SAMD12Q8N8I0 201 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 SNX31Q8N9S9 440 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 OR13A1Q8NGR1 328 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 OR6N2Q8NGY6 317 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 NUBPLQ8TB37 319 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 TMEM239Q8WW34 195 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 ANKRD7Q92527 254 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 UFD1Q92890 307 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 MYDGFQ969H8 173 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 APH1AQ96BI3 265 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 NTNG2Q96CW9 530 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CHMP6Q96FZ7 201 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 RNF170Q96K19 258 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 CTRCQ99895 268 aa2.12□□□□□ -2.07
ATRX-220ENST00000635865 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
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