RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602762.5

UBE2E3-210, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2E3, Length 340 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-210ENST00000602762 SMR3AQ99954 134 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 GSX2Q9BZM3 304 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 IKZF5Q9H5V7 419 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 ASB6Q9NWX5 421 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 UPB1Q9UBR1 384 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2E3-210ENST00000602762 ABCA4P78363 2273 aa6.9□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 AKAP6Q13023 2319 aa6.9□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 AQP7P3A6NL99 342 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 EVPLLA8MZ36 301 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 H7C1Q1 480 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 PDLIM1O00151 329 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 TPST1O60507 370 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 TMCC2O75069 709 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 NPIPB7O75200 414 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 RAD51DO75771 328 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 AHSA1O95433 338 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 SOD3P08294 240 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 ITGA5P08648 1049 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 DANCRP0C864 163 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 PAX1P15863 534 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 PRKAR1BP31321 381 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 P2RY4P51582 365 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 ATP5J2P56134 94 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 EGR4Q05215 589 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 SCARB2Q14108 478 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 ADRM1Q16186 407 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 GABRA6Q16445 453 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 REEP3Q6NUK4 255 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 CASP12Q6UXS9 341 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 AAED1Q7RTV5 226 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 BIVMQ86UB2 503 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 RETREG3Q86VR2 466 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 COMTD1Q86VU5 262 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 KRT73Q86Y46 540 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 WDR31Q8NA23 367 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 STK35Q8TDR2 534 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 STON2Q8WXE9 905 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 TMEM45BQ96B21 275 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 C3orf49Q96BT1 292 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 ZNF385DQ9H6B1 395 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 MALT1Q9UDY8 824 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 A0A0G2JND7 137 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 A0A1B0GWA3 101 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 A0A1W2PR80 420 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 TRIM64BA6NI03 449 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 SHISA9B4DS77 424 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 OVOL3O00110 214 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 SERPINB7O75635 380 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 MFN2O95140 757 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 VAMP5O95183 116 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 SLC6A2P23975 617 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 HTR2AP28223 471 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 MPGP29372 298 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 AQP1P29972 269 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 ZNF83P51522 516 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 PGGHGQ32M88 737 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 GPAT4Q86UL3 456 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2E3-210ENST00000602762 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms