RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589537.1

NFIC-208, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 2

Gene NFIC, Length 977 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-208ENST00000589537 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 CLOCKO15516 846 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 FRS3O43559 492 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 RAMP1O60894 148 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 NPIPB7O75200 414 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 SASH3O75995 380 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 PNMTP11086 282 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 NCALDP61601 193 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 TMEM225Q6GV28 225 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 BIVMQ86UB2 503 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 TMEM99Q8N816 258 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 ELOA3Q8NG57 546 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 SELENONQ9NZV5 590 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 MGAT4BQ9UQ53 548 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 RASD1Q9Y272 281 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIC-208ENST00000589537 FAM171A2A8MVW0 826 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 OR2T1O43869 369 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 RAD51DO75771 328 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 AKR7A3O95154 331 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 PLAUP00749 431 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 IGHV3-9P01782 118 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 PTH2RP49190 550 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 BSPH1Q075Z2 132 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 FAPQ12884 760 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 BNIP2Q12982 314 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 C18orf12Q96KH6 178 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 MUS81Q96NY9 551 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 CGREF1Q99674 301 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 PDLIM1O00151 329 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 FZD7O75084 574 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 PAX7P23759 505 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 NTF4P34130 210 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 NFYCQ13952 458 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ADRM1Q16186 407 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 CYP51A1Q16850 503 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ULK3Q6PHR2 472 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 AAED1Q7RTV5 226 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 GPAT4Q86UL3 456 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 C10orf111Q8N326 155 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 SLC38A4Q969I6 547 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 PERPQ96FX8 193 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.63□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 DPRXA6NFQ7 191 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ITGA5P08648 1049 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 PTAFRP25105 342 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 MPGP29372 298 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 HOXC5Q00444 222 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 MFSD13AQ14CX5 517 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 GABRA6Q16445 453 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 OR6S1Q8NH40 331 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 SLC47A1Q96FL8 570 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 EPYCQ99645 322 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 BDH2Q9BUT1 245 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 OBP2BQ9NPH6 170 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms