RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PINLYPA6NC86 204 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRN3E7EW58 273 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 BHLHE40O14503 412 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC159P0C7I6 412 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 GABRB1P18505 474 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 IDUAP35475 653 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PCYT1AP49585 367 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 IQCF1Q8N6M8 205 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL1Q9NR64 748 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF226Q9NYT6 803 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2M5A3KFT3 312 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SHISA8B8ZZ34 492 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 FTCDNL1E5RQL4 147 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TFPIP10646 304 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 GDF1P27539 372 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 UQCRC1P31930 480 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TOMM20Q15388 145 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SGCBQ16585 318 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A30Q5SVS4 291 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 C1QL3Q5VWW1 255 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 IGFL3Q6UXB1 125 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SCAIQ8N9R8 606 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4Q3Q8NH05 313 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5J2Q8NH18 312 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 Q96MT0 163 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 IFT27Q9BW83 186 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TAPBPLQ9BX59 468 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ASPNQ9BXN1 380 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 HES7Q9BYE0 225 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 RASSF1Q9NS23 344 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TVP23BQ9NYZ1 205 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV17A0A0B4J275 112 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 GJE1A6NN92 205 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 K7ENP7 123 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 RFPL3SP0C7P2 107 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 RAC1P63000 192 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 EFNB1P98172 346 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TLE3Q04726 772 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SNAPC1Q16533 368 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 THSD4Q6ZMP0 1018 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 OR14L1PQ8NHC6 308 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 CNIH3Q8TBE1 160 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TTTY12Q9BZ98 90 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC6A5Q9Y345 797 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SH3D21A4FU49 640 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BML4 177 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 HPNP05981 417 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 MEOX1P50221 254 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM26EQ8N5C1 309 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2FQ969M7 185 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHA8Q96JA3 519 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL5BQ96KC2 179 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAPPC4Q9Y296 219 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 IDH3BO43837 385 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 WBP4O75554 376 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 GLSO94925 669 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 APEHP13798 732 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 IL11P20809 199 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM201Q5SNT2 666 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 MEDAGQ5VYS4 303 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC6A19Q695T7 634 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 APH1BQ8WW43 257 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A36Q96CQ1 311 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ENKD1Q9H0I2 346 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 CLN6Q9NWW5 311 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ALKBH4Q9NXW9 302 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 IL20RAQ9UHF4 553 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM64A6NGJ6 449 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ARPC3O15145 178 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SURF4O15260 269 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PEPDP12955 493 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 GRPRP30550 384 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 B3GALT5-AS1P59052 145 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PLGLB1Q02325 96 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 OCLNQ16625 522 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 LAIR2Q6ISS4 152 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A16Q86VW1 577 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ZADH2Q8N4Q0 377 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TCEANCQ8N8B7 351 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM163Q8TC26 289 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 DCBLD2Q96PD2 775 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 FN3KQ9H479 309 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 NRIP3Q9NQ35 241 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SCN3BQ9NY72 215 aa27.95■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 LIPT2A6NK58 231 aa27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms