RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	12.22	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	USF3	Q68DE3	2245 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	PDLIM1	O00151	329 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	HS3ST1	O14792	307 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	TPST1	O60507	370 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	SMPD2	O60906	423 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	TMCC2	O75069	709 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	FZD7	O75084	574 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	AHSA1	O95433	338 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	PLAU	P00749	431 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	IGHV3-9	P01782	118 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	HTR2A	P28223	471 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	P2RY4	P51582	365 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	MTPN	P58546	118 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	EGR4	Q05215	589 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	NFYC	Q13952	458 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	SELPLG	Q14242	412 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	PPA1	Q15181	289 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	STK11	Q15831	433 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	SHE	Q5VZ18	495 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	CASP12	Q6UXS9	341 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	COMTD1	Q86VU5	262 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF611	Q8N823	705 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	ELOA3	Q8NG57	546 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PKD1-231	ENST00000566784		A0A1B0GWA3	101 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	OR5H1	A6NKK0	313 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	ARHGEF9	O43307	516 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	RAD51D	O75771	328 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	MFN2	O95140	757 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	CD3E	P07766	207 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	ITGA5	P08648	1049 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	PNMT	P11086	282 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	AQP1	P29972	269 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	ARFIP2	P53365	341 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	DMTN	Q08495	405 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	FAP	Q12884	760 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	CYP51A1	Q16850	503 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	COQ5	Q5HYK3	327 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM225	Q6GV28	225 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	CGB2	Q6NT52	195 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	ULK3	Q6PHR2	472 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	MED4	Q9NPJ6	270 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	DLL4	Q9NR61	685 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	UPB1	Q9UBR1	384 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	RASD1	Q9Y272	281 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	ZFHX3	Q15911	3703 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784		A0A0B4J2E0	115 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784		A0A1B0GX12	115 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	CIB4	A0PJX0	185 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	FBP2	O00757	339 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	OR2T1	O43869	369 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	C8B	P07358	591 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	FOSL1	P15407	271 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	PAX1	P15863	534 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	PCGF2	P35227	344 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	NCALD	P61601	193 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	BSPH1	Q075Z2	132 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	GPAT4	Q86UL3	456 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	P3H2	Q8IVL5	708 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
PKD1-231	ENST00000566784	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46

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