RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 RANBP9Q96S59 729 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 CIB1Q99828 191 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 GAL3ST1Q99999 423 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 SIKE1Q9BRV8 207 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 ERP44Q9BS26 406 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 TBCDQ9BTW9 1192 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 VCXQ9H320 206 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 SDHAF3Q9NRP4 125 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 RDH8Q9NYR8 311 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 PRODH2Q9UF12 536 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 VANGL2Q9ULK5 521 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 GINS2Q9Y248 185 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 CSAG2Q9Y5P2 127 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 PLIN4Q96Q06 1357 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-212ENST00000557477 CHD9Q3L8U1 2897 aa3.59□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 FER1L5A0AVI2 2057 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 PIEZO1Q92508 2521 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF840PA6NDX5 716 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 CCT8L1PA6NM43 557 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 WASHC1A8K0Z3 465 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 SYCE1LA8MT33 242 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 E9PAM4 449 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 GOLGA8RI6L899 631 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 CASKO14936 926 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 MAPK13O15264 365 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 TM9SF1O15321 606 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 PEX11AO75192 247 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 KBTBD11O94819 623 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 PIGRP01833 764 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 ALOX5P09917 674 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 ALPIP09923 528 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 HPGDP15428 266 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 IDSP22304 550 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 IGFBP5P24593 272 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 AXLP30530 894 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 ATP5OP48047 213 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 ARHGDIBP52566 201 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 IST1P53990 364 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 IL9RQ01113 521 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 KDSRQ06136 332 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 OVGP1Q12889 678 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 DNAJC3Q13217 504 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 SLC10A1Q14973 349 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 KLHL38Q2WGJ6 581 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM52BQ4KMG9 183 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 SLC22A6Q4U2R8 563 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 EIPR1Q53HC9 387 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 SLX4IPQ5VYV7 408 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 ASPHD2Q6ICH7 369 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 ASCL5Q7RTU5 278 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 FAM228AQ86W67 206 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 NAXDQ8IW45 347 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 STKLD1Q8NE28 680 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 OR6C4Q8NGE1 309 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 PPTC7Q8NI37 304 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 STARD8Q92502 1023 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 TADA1Q96BN2 335 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 HAUS1Q96CS2 278 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 HPDLQ96IR7 371 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 ELMO2Q96JJ3 720 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 NUP58Q9BVL2 599 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 EHD1Q9H4M9 534 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 WDR76Q9H967 626 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 HEY1Q9Y5J3 304 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 ABCB11O95342 1321 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 TTC41PQ6P2S7 1318 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 PCNX3Q9H6A9 2034 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 CHD7Q9P2D1 2997 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM114B3SHH9 223 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 GOLGA8SH3BPF8 625 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 HIP1O00291 1037 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 PPIHO43447 177 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 CRYZL1O95825 349 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 JCHAINP01591 159 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 KRT6AP02538 564 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 LGALS2P05162 132 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-212ENST00000557477 RETP07949 1114 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms