RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551920.1

GCN1-209, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

TSL 3

Gene GCN1, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-209ENST00000551920 CCKARP32238 428 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 CTBP2P56545 445 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 GDF7Q7Z4P5 450 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 MCEMP1Q8IX19 187 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 TMEM99Q8N816 258 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 RNF217Q8TC41 542 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 TAAR8Q969N4 342 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 SLC41A3Q96GZ6 507 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 C12orf49Q9H741 205 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 GP6Q9HCN6 339 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 TAS2R1Q9NYW7 299 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.55□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 AQP7P3A6NL99 342 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 PDE5AO76074 875 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 NTF4P34130 210 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 SLC16A1P53985 500 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 LTBQ06643 244 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 PIGXQ8TBF5 258 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 LZICQ8WZA0 190 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 TMEM43Q9BTV4 400 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 GORASP2Q9H8Y8 452 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 SELENONQ9NZV5 590 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 PROCRQ9UNN8 238 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 V9GYQ6 96 aa14.54□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 ZNF724A8MTY0 619 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 LRRN3E7EW58 273 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 J3KTA2 159 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 FFAR1O14842 300 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 PRSS23O95084 383 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 OR5F1O95221 314 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 BGLAPP02818 100 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 YES1P07947 543 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 ATP6V1B2P21281 511 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 TAS2R41P59536 307 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 SLC17A1Q14916 467 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 PDK3Q15120 406 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 SPATS1Q496A3 300 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 IFI44LQ53G44 452 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 PRRC1Q96M27 445 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 RIMS3Q9UJD0 308 aa14.53□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
GCN1-209ENST00000551920 M0R082 166 aa14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 SEMG1P04279 462 aa14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 IFNW1P05000 195 aa14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 CBLP22681 906 aa14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 C5orf46Q6UWT4 87 aa14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 ZNF417Q8TAU3 575 aa14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 TMEM255BQ8WV15 326 aa14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 MPP4Q96JB8 637 aa14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 C1orf21Q9H246 121 aa14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 MPDZO75970 2070 aa14.52□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 PRF1P14222 555 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 COX6B1P14854 86 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 GRPRP30550 384 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 OR3A2P47893 321 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 UGT2B15P54855 530 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms