RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 TMEM129A0AVI4 362 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 LSM1O15116 133 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 CFLARO15519 480 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 VAMP5O95183 116 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 C6orf47O95873 294 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 IMPDH2P12268 514 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 UQCRBP14927 111 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 CCNA2P20248 432 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 SOAT1P35610 550 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 IDH2P48735 452 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 DNAJB13P59910 316 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 DAG1Q14118 895 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 ELFN2Q5R3F8 820 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 ATAD3BQ5T9A4 648 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 LIPMQ5VYY2 423 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 CLEC6AQ6EIG7 209 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 TMEM225Q6GV28 225 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 ACSM5Q6NUN0 579 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 C8orf74Q6P047 294 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 EMBQ6PCB8 327 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 ZYG11AQ6WRX3 759 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 GPAT4Q86UL3 456 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 CCDC36Q8IYA8 594 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 ANKK1Q8NFD2 765 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 OR7A2PQ8NGA2 310 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 RAB39BQ96DA2 213 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 SLC6A7Q99884 636 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 OXSMQ9NWU1 459 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 TREM2Q9NZC2 230 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 KCNE5Q9UJ90 142 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 TMED7Q9Y3B3 224 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 WDR45Q9Y484 360 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 TENM1Q9UKZ4 2725 aa10.27□□□□□ -0.76
CS-228ENST00000551473 LOC105371242A0A075B767 164 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 AQP7P3A6NL99 342 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 POM121CA8CG34 1229 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 AZIN1O14977 448 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 PPIHO43447 177 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 FCMRO60667 390 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 GSNP06396 782 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 LAMP1P11279 417 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 BCKDHAP12694 445 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 GATA3P23771 443 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 SLC7A5Q01650 507 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 GALNTL6Q49A17 601 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 AP1ARQ63HQ0 302 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 ZDHHC22Q8N966 263 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 ZIC4Q8N9L1 334 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 OR2T11Q8NH01 316 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 SLC35G5Q96KT7 338 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 TAPBPLQ9BX59 468 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 LINC00470Q9BZP3 86 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 G6PC2Q9NQR9 355 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 OSGIN1Q9UJX0 560 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 A0A096LPE4 126 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 A0A1W2PPZ6 126 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 TMEM72A0PK05 275 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 G3V2L1 256 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 NR5A2O00482 541 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 GLRA3O75311 464 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 LMO4P61968 165 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 RPS23P62266 143 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 ETF1P62495 437 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 TUBA1BP68363 451 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 TUBA4AP68366 448 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 KCNJ10P78508 379 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 HPCAP84074 193 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 NPRL3Q12980 569 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 CEACAM7Q14002 265 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 OCLNQ16625 522 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 CCDC153Q494R4 210 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 MMEL1Q495T6 779 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 NIPAL3Q6P499 406 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 TUBA1AQ71U36 451 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 C6orf120Q7Z4R8 191 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 TREML1Q86YW5 311 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 CMIPQ8IY22 773 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 TMEM99Q8N816 258 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 OR5AK3PQ8NH89 298 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 PPP3R2Q96LZ3 170 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 FMO2Q99518 471 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 SERHL2Q9H4I8 314 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 ZNF385DQ9H6B1 395 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 SEC61A2Q9H9S3 476 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 NOX3Q9HBY0 568 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 CRLF2Q9HC73 371 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-228ENST00000551473 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms