RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535094.6

MCF2L-232, Transcript of MCF.2 cell line derived transforming sequence like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene MCF2L, Length 3,752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L-232ENST00000535094 MNTQ99583 582 aa14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 F13BP05160 661 aa14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 ZNF85Q03923 595 aa14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 IRF4Q15306 451 aa14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 RPE65Q16518 533 aa14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 MLXQ9UH92 298 aa14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.66□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 A0A1W2PPV9 198 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 AGR2O95994 175 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 HTR2AP28223 471 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 MMP15P51511 669 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 OR51Q1Q8NH59 317 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 B3GNT4Q9C0J1 378 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 PLPP2O43688 288 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 NFATC1O95644 943 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 S100A11P31949 105 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 CHST4Q8NCG5 386 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 SMARCD2Q92925 531 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 VOPP1Q96AW1 172 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 IL21RQ9HBE5 538 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 ADGRL4Q9HBW9 690 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 A0A1W2PQU0 124 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 C11orf98E9PRG8 122 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 TYRP1P17643 537 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 GRK6P43250 576 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 ACTA2P62736 377 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 ACTG2P63267 376 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 LNX2Q8N448 690 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.65□□□□□ -0.06
MCF2L-232ENST00000535094 URADA6NGE7 173 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 VAMP1P23763 118 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 SKP1P63208 163 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 CDK5R1Q15078 307 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 PDGFRLQ15198 375 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 SLC51BQ86UW2 128 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 PTTG3PQ9NZH4 202 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 F5H5P2 479 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 NDUFB2O95178 105 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 GUCA2AQ02747 115 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 CBFBQ13951 182 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 GSG1LQ6UXU4 331 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 OR51D1Q8NGF3 324 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 NCDNQ9UBB6 729 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 LAMP5Q9UJQ1 280 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 SIGLEC7Q9Y286 467 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 NDUFS1P28331 727 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 CCKBRP32239 447 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 THBS2P35442 1172 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 ZP1P60852 638 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 RAP2BP61225 183 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 ERV3-1Q14264 604 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 TMEM31Q5JXX7 168 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 KCTD9Q7L273 389 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 ZNF563Q8TA94 476 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 AICDAQ9GZX7 198 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 NTMQ9P121 344 aa14.64□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 CSTAP01040 98 aa14.63□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 LPLP06858 475 aa14.63□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 DLX5P56178 289 aa14.63□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 TMUB2Q71RG4 321 aa14.63□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.63□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.63□□□□□ -0.07
MCF2L-232ENST00000535094 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms