RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGFL3Q6UXB1 125 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 RPTNQ6XPR3 784 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF836Q6ZNA1 936 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ASB18Q6ZVZ8 466 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 COMTD1Q86VU5 262 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 EPHX4Q8IUS5 362 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 LACC1Q8IV20 430 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 EID3Q8N140 333 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM86B1Q8N7N1 296 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 WDSUB1Q8N9V3 476 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 PSD4Q8NDX1 1056 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR52E4Q8NGH9 312 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR4D11Q8NGI4 311 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CANT1Q8WVQ1 401 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 LZICQ8WZA0 190 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 PROX1Q92786 737 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 NTNG2Q96CW9 530 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARSGQ96EG1 525 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 C5orf34Q96MH7 638 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 RNF145Q96MT1 663 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLHDC3Q9BQ90 382 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHID1Q9BWS9 393 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 PINK1Q9BXM7 581 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 UGT2B28Q9BY64 529 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRIM15Q9C019 465 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARMC7Q9H6L4 198 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 DEPPQ9NTK1 212 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 OLAHQ9NV23 265 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLHL28Q9NXS3 571 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLRF1Q9NZS2 232 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ANAPC2Q9UJX6 822 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 AURKCQ9UQB9 309 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 NTNG1Q9Y2I2 539 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CSAG2Q9Y5P2 127 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 V9GYQ6 96 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 DCHS1Q96JQ0 3298 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 DSPPQ9NZW4 1301 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRAV17A0A0B4J275 112 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A0G2JMM0 328 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A1W2PPB8 328 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A1W2PQD3 144 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A1W2PRS3 328 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDHR4A6H8M9 788 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 LIPT2A6NK58 231 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 KIR3DP1A8MWS1 328 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 NUDT19A8MXV4 375 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 hCG_2039718K7EN88 272 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADAM10O14672 748 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF264O43296 627 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZIC3O60481 467 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ENTPD5O75356 428 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC25A12O75746 678 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CBR3O75828 277 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRAPPC6AO75865 159 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 DIRAS1O95057 198 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPARCP09486 303 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 RFPL3SP0C7P2 107 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 RFC3P40938 356 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 IDH2P48735 452 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTTG1IPP53801 180 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF117Q03924 483 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHRNB3Q05901 458 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SNTA1Q13424 505 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR1Q1Q15612 314 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZSWIM7Q19AV6 140 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 LIN52Q52LA3 116 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 IFI44LQ53G44 452 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 COLEC12Q5KU26 742 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 FNDC7Q5VTL7 733 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CARM1Q86X55 608 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLCZ1Q86YW0 608 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 AQP12AQ8IXF9 295 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 C10orf67Q8IYJ2 551 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 MDS2Q8NDY4 140 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR2M7Q8NG81 312 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms