RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 CASKO14936 926 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 PLOD3O60568 738 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 TSPAN2O60636 221 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 GBAP04062 536 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CHRM4P08173 479 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 INHBAP08476 426 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 MYZAPP0CAP1 466 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 KRT20P35900 424 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SLCO1A2P46721 670 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CLDN18P56856 261 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 LTBQ06643 244 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 RASA2Q15283 850 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 TOMM20Q15388 145 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SPIN4Q56A73 249 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 PRR22Q8IZ63 422 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 LINC01560Q8TB33 94 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 TM4SF18Q96CE8 201 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 ARSGQ96EG1 525 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 PHF21BQ96EK2 531 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SFXN2Q96NB2 322 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 NODALQ96S42 347 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 NLKQ9UBE8 527 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 DKKL1Q9UK85 242 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 NINQ8N4C6 2090 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 A0A1W2PPR1 153 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SLC22A20A6NK97 555 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 TTC36A6NLP5 189 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 EMC8O43402 210 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 PSMG1O95456 288 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 PDYNP01213 254 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 KRT6AP02538 564 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 KRT6BP04259 564 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CT45A8P0DMV1 189 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CT45A9P0DMV2 189 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 PAX1P15863 534 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CRYGSP22914 178 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 IL12BP29460 328 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CPOXP36551 454 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CD79BP40259 229 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 KRT6CP48668 564 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 GAS1P54826 345 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 NAA20P61599 178 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 C2orf54Q08AI8 447 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 GUSBP1Q15486 140 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 NNATQ16517 81 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 AWAT2Q6E213 333 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 C8orf74Q6P047 294 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 LUZP2Q86TE4 346 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SERPINA11Q86U17 422 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 FADS6Q8N9I5 356 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 DOK4Q8TEW6 326 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 TMBIM1Q969X1 311 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 MARK4Q96L34 752 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF382Q96SR6 550 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 OR10A4Q9H209 315 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 RNF122Q9H9V4 155 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 A8MT66 165 aa6.03□□□□□ -1.44
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