RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 CALHM3Q86XJ0 350 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 LSMEM1Q8N8F7 131 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ELOA3Q8NG57 546 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52E4Q8NGH9 312 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 APH1AQ96BI3 265 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 RCN3Q96D15 328 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGDIGQ99819 225 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 UBTD1Q9HAC8 227 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0B4J2E0 115 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1B0GX12 115 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 PRORSD1PA6NEY8 169 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP8B1O43520 1251 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 RAD51DO75771 328 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP3CBP16298 524 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC24CP53992 1094 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 GYS2P54840 703 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 NCALDP61601 193 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 RBBP4Q09028 425 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGADQ13349 1161 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 NRF1Q16656 503 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 VMACQ2NL98 169 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 ALG10BQ5I7T1 473 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 GPAT4Q86UL3 456 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 TREML1Q86YW5 311 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 ZIC4Q8N9L1 334 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 STEAP2Q8NFT2 490 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 OR9K2Q8NGE7 335 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 OR8J3Q8NGG0 315 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 PLPPR2Q96GM1 343 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10A4Q9H209 315 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 FANCFQ9NPI8 374 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 M0QX08 132 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINB7O75635 380 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 AHSA1O95433 338 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGA5P08648 1049 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 PNMTP11086 282 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 CD53P19397 219 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 DNASE1P24855 282 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 LGALS3BPQ08380 585 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 P2RY6Q15077 328 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 MAPRE2Q15555 327 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1Q1Q15612 314 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 STK11Q15831 433 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf135Q5VTT2 229 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXW9Q5XUX1 488 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2J2Q8N2K1 259 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 OR6T1Q8NGN1 323 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 STK35Q8TDR2 534 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A36Q96CQ1 311 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 TAPBPLQ9BX59 468 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 MALT1Q9UDY8 824 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 CCT8L1PA6NM43 557 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR171O14626 319 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 FZD7O75084 574 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 LGI1O95970 557 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 THY1P04216 161 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFRSF1BP20333 461 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 CBLP22681 906 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 KEAP1Q14145 624 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 BEX5Q5H9J7 111 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR88Q6ZMY6 472 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 KDM8Q8N371 416 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF217Q8TC41 542 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 TAAR8Q969N4 342 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM2Q9C040 744 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM107BQ9H098 131 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 CXXC4Q9H2H0 198 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 C12orf10Q9HB07 376 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC7A10Q9NS82 523 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 NPAP1Q9NZP6 1156 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC13A4Q9UKG4 626 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PR80 420 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRN3E7EW58 273 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 PDLIM1O00151 329 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 CDH12P55289 794 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 FAPQ12884 760 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPO2Q5TGU0 170 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 ULK3Q6PHR2 472 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 SPNS3Q6ZMD2 512 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA21Q7Z572 469 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 MFSD8Q8NHS3 518 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM45BQ96B21 275 aa16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms