RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CASP12	Q6UXS9	341 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM99	Q8N816	258 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	PIGT	Q969N2	578 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ASB6	Q9NWX5	421 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327		A0A1B0GWA3	101 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	OR5H1	A6NKK0	313 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	PDLIM1	O00151	329 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	FXYD1	O00168	92 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	NPPA	P01160	153 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	PNMT	P11086	282 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	GGT1	P19440	569 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	AQP1	P29972	269 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	PCGF2	P35227	344 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	DMTN	Q08495	405 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	KLF10	Q13118	480 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	MAPRE2	Q15555	327 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ELOA3	Q8NG57	546 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CCL19	Q99731	98 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SAR1A	Q9NR31	198 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327		A0A0B4J2E0	115 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327		A0A1B0GX12	115 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	HS3ST1	O14792	307 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SLC22A2	O15244	555 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ATP8B1	O43520	1251 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	OR2T1	O43869	369 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	FMO6P	O60774	539 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	TMCC2	O75069	709 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	IGHV3-9	P01782	118 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	C8B	P07358	591 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ITGA5	P08648	1049 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	HOXC12	P31275	282 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ADAM8	P78325	824 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	FAP	Q12884	760 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	PPA1	Q15181	289 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	STK11	Q15831	433 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	NRF1	Q16656	503 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	REP15	Q6BDI9	236 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ULK3	Q6PHR2	472 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF611	Q8N823	705 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SLC38A4	Q969I6	547 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ARHGDIG	Q99819	225 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	SH3GL1	Q99961	368 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	RASD1	Q9Y272	281 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CAD	P27708	2225 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	ARID1A	O14497	2285 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	NF1	P21359	2839 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	MTOR	P42345	2549 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	MRAS	O14807	208 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	RAD51D	O75771	328 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	LGI1	O95970	557 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	PLAU	P00749	431 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	CD3E	P07766	207 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	GZMM	P51124	257 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM28-208	ENST00000495327	OR1Q1	Q15612	314 aa		11.74	□□□□□ -0.53

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