RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 M0R129 80 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 UGT2B7P16662 529 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 CTBP2P56545 445 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 CDC42P60953 191 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 ZIC1Q15915 447 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 ST3GAL2Q16842 350 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 GSG1Q2KHT4 349 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 SERPINA11Q86U17 422 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 ANKRD46Q86W74 232 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 SLC5A8Q8N695 610 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 AMDHD1Q96NU7 426 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 ZNF382Q96SR6 550 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 SSX3Q99909 188 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 ABCG5Q9H222 651 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 ASB1Q9Y576 335 aa7.06□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 CCDC187A0A096LP49 1063 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 TAPBPO15533 448 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 MTX2O75431 263 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 NDUFS3O75489 264 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 KDM4BO94953 1096 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 HPP00738 406 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 TCRBP04435 133 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 PEPDP12955 493 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 CTSEP14091 401 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 ADCYAP1P18509 176 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 UQCRC2P22695 453 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 KDELR2P33947 212 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 DOC2AQ14183 400 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 PTGR1Q14914 329 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 NR6A1Q15406 480 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 NTRK2Q16620 822 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 PRTGQ2VWP7 1150 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 CASP12Q6UXS9 341 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 TAF8Q7Z7C8 310 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 OR4N4Q8N0Y3 316 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 PNPLA1Q8N8W4 532 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 TM9SF4Q92544 642 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 NTNG2Q96CW9 530 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 GGACTQ9BVM4 153 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 PCBD2Q9H0N5 130 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 SERHLQ9NQF3 203 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 TMEM184CQ9NVA4 438 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 IFITM10A6NMD0 228 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 L7N2F9 121 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 DUX1O43812 170 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 SLC19A2O60779 497 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 SOX30O94993 753 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 IGHV2-5P01817 119 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 MBP02144 154 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 OR8U8P0C7N1 319 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 RNH1P13489 461 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 DRD2P14416 443 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 CD46P15529 392 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 PRPH2P23942 346 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 ITGA3P26006 1051 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 PTPN6P29350 595 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 UGT8Q16880 541 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 HACD4Q5VWC8 232 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 OR10G2Q8NGC3 310 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 HSD17B8Q92506 261 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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USP4-211ENST00000485450 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 NLNQ9BYT8 704 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 DNAJB11Q9UBS4 358 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 OR2AG2A6NM03 316 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 FFAR3O14843 346 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 GPR42O15529 346 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 LANCL1O43813 399 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 TOXO94900 526 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.05□□□□□ -1.28
USP4-211ENST00000485450 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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